antibioticsАнтибиотики и ХимиотерапияAntibiot Khimioter = Antibiotics and Chemotherapy0235-2990ООО «Издательство ОКИ»10.37489/0235-2990-2023-68-7-8-34-41antibiotics-1061Research ArticleКЛИНИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРАКТИКАGUIDELINES FOR PRACTITIONERSАнализ распределения генетических факторов, ассоциированных с тяжёлым течением COVID-19, в этнических группах Восточного КавказаDistribution of Genetic Factors Associated with Severe COVID-19 in Ethnic Groups of the Eastern Caucasushttps://orcid.org/0000-0001-9001-1499АбдуллаевШ. П.AbdullaevS. Р.

Абдуллаев Шерзод Пардабоевич — к. б. н., заведующий отделом предиктивных и прогностических биомаркеров научно-исследовательского института  молекулярной и персонализированной медицины

Москва, ул. Баррикадная, д. 2/1, стр. 1, г., 125993

Sherzod P. Abdullaev — Ph. D. in Biology, Head of the Department of Predictive and Prognostic Biomarkers of the Research Institute of Molecular and Personalized Medicine

2/1 Barrikadnaya st., bld. 1, Moscow, 125993

abdullaevsp@gmail.comhttps://orcid.org/0009-0003-2256-6662МаммаевК. М.-Б.MammaevК. М.-В.

Маммаев Камал Магомед-Багович — студент

Махачкала

Kamal M.-B. Mammaev — undergraduate studen

Makhachkala

https://orcid.org/0000-0003-3278-5941ДенисенкоН. П.DenisenkoN. Р.

Денисенко Наталья Павловна — к. м. н., заместитель директора научно-исследовательского института молекулярной и персонализированной медицины; доцент кафедры клинической фармакологии и терапии им. академикаБ. Е. Вотчала

Москва

Natalia P. Denisenko — Ph. D. in Medicine, Deputy Director of the Research Institute of Molecular and Personalized Medicine; Associate Professor of the Department of Clinical Pharmacology and Therapy named after Academician B. E. Votchal

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-1242-0833ТемирбулатовИ. И.TemirbulatovI. L.

Темирбулатов Ильяс Ильдарович — аспирант кафедры клинической фармакологии и терапии им. академика Б. Е. Вотчала

Москва

Ilyas I. Temirbulatov — postgraduate student of the Department of Clinical Pharmacology and Therapy named after Academician B. E. Votchal

Moscow

https://orcid.org/0000-0003-3194-4410КачановаА. А.KachanovaA. А.

Качанова Анастасия Алексеевна — младший научный сотрудник отдела предиктивных и прогностических биомаркеров научно-исследовательского института молекулярной и персонализированной медицины

Москва

Anastasia A. Kachanova — junior researcher, Department of Predictive and Prognostic Biomarkers of the Research Institute of Molecular and Personalized Medicine

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-6175-8179МихайленкоЕ. В.MikhaylenkoE. V.

Михайленко Елизавета Вячеславовна — аспирант кафедры фармакологии

Москва

Elizaveta V. Mikhaylenko — postgraduate student, Department of Pharmacology

Moscow

https://orcid.org/0000-0001-7903-2977КрюковА. В.KryukovА. V.

Крюков Александр Валерьевич — к. м. н., доцент кафедры клинической фармакологии и терапии им. академикаБ. Е. Вотчала

Москва

Alexander V. Kryukov — Ph. D. in Medicine, Associate Professor of the Department of Clinical Pharmacology and Therapy named after Academician B. E. Votchal

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-1469-2365ВалиевТ. Т.ValievТ. Т.

Валиев Тимур Таймуразович — д. м. н., доцент, профессор кафедры детской онкологии им. академика Л. А. Дурнова

Москва

Timur T. Valiev — D. Sc. in Medicine, Associate Professor, Professor of the Department of Pediatric Oncology named after Academician L. A. Durnov

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-9307-4994МирзаевК. Б.MirzaevК. В.

Мирзаев Карин Бадавиевич — д. м. н., проректор по научной работе и инновациям, директор научно-исследовательского института молекулярной и персонализированной медицины

Москва

Karin B. Mirzaev — D. Sc. in Medicine, Vice-Rector for Research and Innovation, Director of the Research Institute of Molecular and Personalized Medicine

Moscow

https://orcid.org/0000-0001-8898-8831МаммаевС. Н.MammaevS. N.

Маммаев Сулейман Нураттинович — д. м. н., профессор, профессор кафедры Госпитальной терапии № 1

Махачкала

Suleiman N. Mammaev — D. Sc. in Medicine, Professor, Professor of the Department of Hospital Therapy No. 1

Makhachkala

https://orcid.org/0000-0002-4496-3680СычевД. А.SychevD. А.

Сычев Дмитрий Алексеевич — д. м. н., профессор, академик РАН, ректор; заведующий кафедрой клинической фармакологии и терапии им. академика Б. Е. Вотчала

Москва

Dmitry A. Sychev — D. Sc. in Medicine, Professor, Academician of the Russian Academy of Sciences, Rector; Head of the Department of Clinical Pharmacology and Therapy named afterAcademician B. E. Votchal

Moscow

ФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образованияРоссияRussian Medical Academy of Continuous Professional EducationRussian FederationДагестанский государственный медицинский университетРоссияDagestan State Medical UniversityRussian FederationПервый МГМУ им. И. М. Сеченова (Сеченовский Университет)РоссияI. M. Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University)Russian FederationФГБОУ ДПО Российская медицинская академия непрерывного профессионального образованияРоссияRussian Medical Academy of Continuous Professional EducationRussian Federation202325122023687-83441Copyright © Абдуллаев Ш.П., Маммаев К.М., Денисенко Н.П., Темирбулатов И.И., Качанова А.А., Михайленко Е.В., Крюков А.В., Валиев Т.Т., Мирзаев К.Б., Маммаев С.Н., Сычев Д.А., 20232023Абдуллаев Ш.П., Маммаев К.М., Денисенко Н.П., Темирбулатов И.И., Качанова А.А., Михайленко Е.В., Крюков А.В., Валиев Т.Т., Мирзаев К.Б., Маммаев С.Н., Сычев Д.А.Abdullaev S.Р., Mammaev К.М., Denisenko N.Р., Temirbulatov I.l., Kachanova A.А., Mikhaylenko E.V., Kryukov А.V., Valiev Т.Т., Mirzaev К.В., Mammaev S.N., Sychev D.А.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/article/view/1061

Обоснование. Для COVID-19 были выявлены генетические маркеры rs11385942 G>GA и rs657152 C>А тяжести заболевания. Изучение распространённости клинически значимых генетических маркеров может быть полезно для разработки регион-специфических подходов борьбы с заболеванием, учитывающих в том числе этнический состав территории, что особенно актуально для России. Учитывая этническую гетерогенность населения республики Дагестан, данный регион был выбран в качестве примера для изучения характера распределения интересующих маркеров тяжести COVID-19. Цель исследования — изучить распространённость маркеров rs11385942 и rs657152 среди пяти этнических групп, проживающих на территории Дагестана. Материал и методы. В исследовании приняли участие 605 здоровых добровольцев (158 мужчин и 447 женщин) из пяти разных автохтонных этнических групп, проживающих на территории республики Дагестан: 118 аварцев, 121 даргинцев, 116 лакцев, 127 кумыков и 123 лезгина. Материалом для определения полиморфизмов служила кровь. Носительство полиморфных маркеров определяли методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Результаты. Распространённость rs11385942 G>GA находится в диапазоне от 10,17% среди аварцев до 15,04% среди лезгинов, были выявлены значимые различия в сравнении с данными по русской этнической группой из источников литературы. Второй маркер rs657152 A>C в изученных группах распределён относительно гомогенно, без значимых различий и соотносится с данными по частоте маркера среди русских, в популяциях на европейском и мировом уровне — 50–60%. Заключение. В локальных этнических группах Дагестана нами было показано, что между собой такие группы не отличаются по носительству обоих изученных маркеров тяжести COVID-19. Вместе с тем, по rs11385942 G>GA частота в проанализированных группах в среднем была выше в сравнении с русскими и средним значением для европейских популяций.

Background. Previously, genetic markers rs11385942 G>GA and rs657152 C>A of disease severity were identified for COVID-19. The study of the prevalence of clinically significant genetic markers may be useful for the development of region-specific approaches to disease control, considering, among other things, the ethnic composition of the territory, which is especially relevant for Russia. Based on the ethnic heterogeneity of the population of the Republic of Dagestan, this region was chosen as an example to study the distribution of COVID-19 severity markers of interest. Objective. Investigation of the prevalence of rs11385942 G>GA and rs657152 C>A markers among five ethnic groups residing in Dagestan. Methods. The study included 605 healthy volunteers (158 men and 447 women) from five different autochthonous ethnic groups living in the Republic of Dagestan: 118 Avars, 121 Dargins, 116 Laks, 127 Kumyks, and 123 Lezgins. Blood served as a material for determining polymorphisms. Carriage of polymorphic markers was determined by real-time polymerase chain reaction method. Results. The prevalence of rs11385942 G>GA marker ranges from 10.17% among Avars to 15.04% among Lezgins; significant differences were found in comparison with Russian ethnic group from literature sources. The second marker – rs657152 A>C — is distributed relatively homogeneously in the studied groups, without significant differences, and correlates with the data on the frequency of marker detection among Russians, as well as among European populations and worldwide — 50–60%. Conclusion. No differences were found within the ethnic groups of Dagestan in the carriage of both studied COVID-19 severity markers. At the same time, the rs11385942 G>GA marker detection frequency in the analyzed groups was on average higher in comparison with Russians and the average values for European populations.

COVID-19rs11385942rs657152этнические группы Дагестанатяжесть заболеваниягенетическая чувствительность к COVID-19COVID-19rs11385942rs657152ethnic groups of Dagestandisease severitygenetic susceptibility to COVID-19Данная работа выполнена при финансовой поддержке Министерства здравоохранения Российской Федерации, тематика государственного задания «Разработка системы поддержки принятия врачебных решений для прогнозирования нежелательных лекарственных реакций у пациентов с COVID-19 на основе фармакогенетического тестирования» (ЕГИСУ НИОКТР №122021800321-2).ReferencesПанель ВОЗ по коронавирусу (COVID-19). URL: https://covid19.who.int/ table (дата обращения 09.07.2023)Panel' VOZ po koronavirusu (COVID-19). URL: https://covid19.who.int/table (data obrashcheniya 09.07.2023)He F., Deng Y., Li W. Coronavirus disease 2019: What we know? J Med Virol. 2020; 92 (7): 719–725. doi: 10.1002/jmv.25766.He F., Deng Y., Li W. Coronavirus disease 2019: What we know? J Med Virol. 2020; 92 (7): 719–725. doi: 10.1002/jmv.25766.Chen N., Zhou M., Dong X. et al. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet. 2020; 395 (10223): 507–513. doi: 10.1016/S0140- 6736(20)30211-7.Chen N., Zhou M., Dong X. et al. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet. 2020; 395 (10223): 507–513. doi: 10.1016/S0140- 6736(20)30211-7.Yang X., Yu Y., Xu J. et al. Clinical course and outcomes of critically ill patients with SARS-CoV-2 pneumonia in Wuhan, China: a single-centered, retrospective, observational study. Lancet Respir Med. 2020; 8 (5): 475–481. doi: 10.1016/S2213-2600(20)30079-5.Yang X., Yu Y., Xu J. et al. Clinical course and outcomes of critically ill patients with SARS-CoV-2 pneumonia in Wuhan, China: a single-centered, retrospective, observational study. Lancet Respir Med. 2020; 8 (5): 475–481. doi: 10.1016/S2213-2600(20)30079-5.Shahid Z., Kalayanamitra R., McClafferty B. et al. COVID-19 and older adults: what we know. J Am Geriatr Soc. 2020; 68 (5): 926–929. doi: 10.1111/jgs.16472.Shahid Z., Kalayanamitra R., McClafferty B. et al. COVID-19 and older adults: what we know. J Am Geriatr Soc. 2020; 68 (5): 926–929. doi: 10.1111/jgs.16472.Wu Z., McGoogan J.M. Characteristics of and important lessons from the coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak in China: summary of a report of 72 314 cases from the Chinese Center for Disease Control and Prevention. JAMA. 2020; 323 (13): 1239–1242. doi: 10.1001/jama.2020.2648.Wu Z., McGoogan J.M. Characteristics of and important lessons from the coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak in China: summary of a report of 72 314 cases from the Chinese Center for Disease Control and Prevention. JAMA. 2020; 323 (13): 1239–1242. doi: 10.1001/jama.2020.2648.Phan L.T., Nguyen T.V., Luong Q.C. et al. Importation and human-tohuman transmission of a novel coronavirus in Vietnam. N Engl J Med. 2020; 382 (9): 872–874. doi: 10.1056/NEJMc2001272.Phan L.T., Nguyen T.V., Luong Q.C. et al. Importation and human-tohuman transmission of a novel coronavirus in Vietnam. N Engl J Med. 2020; 382 (9): 872–874. doi: 10.1056/NEJMc2001272.Европейский центр по профилактике и контролю заболеваний. URL: https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19-pandemic (дата обращения 12.07.2023)Evropejskij tsentr po profilaktike i kontroljyu zabolevanij. URL: https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19-pandemic (data obrashcheniya 12.07.2023)Ghasemian R., Shamshirian A., Heydari K. et al. The role of vitamin D in the age of COVID-19: A systematic review and meta-analysis. Int J Clin Pract. 2021; 75 (11): e14675. doi: 10.1111/ijcp.14675.Ghasemian R., Shamshirian A., Heydari K. et al. The role of vitamin D in the age of COVID-19: A systematic review and meta-analysis. Int J Clin Pract. 2021; 75 (11): e14675. doi: 10.1111/ijcp.14675.Rhodes J.M., Subramanian S., Laird E. et al. Perspective: Vitamin D deficiency and COVID-19 severity — plausibly linked by latitude, ethnicity, impacts on cytokines, ACE2 and thrombosis. J Intern Med. 2021; 289 (1): 97–115. doi: 10.1111/joim.13149.Rhodes J.M., Subramanian S., Laird E. et al. Perspective: Vitamin D deficiency and COVID-19 severity — plausibly linked by latitude, ethnicity, impacts on cytokines, ACE2 and thrombosis. J Intern Med. 2021; 289 (1): 97–115. doi: 10.1111/joim.13149.Severe Covid-19 GWAS Group; Ellinghaus D., Degenhardt F., Bujanda L. et al. Genomewide Association Study of Severe Covid-19 with respiratory failure. N Engl J Med. 2020; 383 (16): 1522–1534. doi: 10.1056/NEJMoa2020283.Severe Covid-19 GWAS Group; Ellinghaus D., Degenhardt F., Bujanda L. et al. Genomewide Association Study of Severe Covid-19 with respiratory failure. N Engl J Med. 2020; 383 (16): 1522–1534. doi: 10.1056/NEJMoa2020283.Мирзаев К.В., Федоринов Д.С., Иващенко Д.В., Сычев Д.А. Мультиэтнический анализ кардиологических фармакогенетических маркеров генов цитохрома Р450 и мембранных транспортеров в российской популяции. Рациональная фармакотерапия в кардиологии. 2019; 15 (3): 393–406. doi: https://doi.org/10.20996/1819-6446-2019-15-3- 393-406.Mirzaev K.B., Fedorinov D.S., Ivashchenko D.V., Sychev D.A. Multi-Ethnic analysis of cardiac pharmacogenetic markers of cytochrome P450 and membrane transporters genes in the Russian population. Rational Pharmacotherapy in Cardiology. 2019; 15 (3): 393–406. doi: https://doi.org/10.20996/1819-6446-2019-15-3-393-406. (in Russian)Мирзаев К.Б., Федоринов Д.С., Акмалова К.А. и др. Анализ носительства клинически значимых аллельных вариантов генов TPMT и DPYD, ассоциированных с ответом на лекарственную терапию в онкогематологической практике, среди 9 этнических групп Российской Федерации. Терапевтический архив. 2020; 92 (8): 43–51. doi: https://doi.org/10.26442/00403660.2020.08.000719.Mirzaev K.B., Fedorinov D.S., Akmalova K.A. et al. Analysis of carrying clinically significant allelic variants of TPMT and DPYD genes associated with the response to drug therapy in cancer practice among 9 ethnic groups of the Russian Federation. Terapevticheskii Arkhiv. 2020; 92 (8): 43–51. doi: https://doi.org/10.26442/00403660.2020.08.000719. (in Russian)Tang H., Quertermous T., Rodriguez B. et al. Genetic structure, selfidentified race/ethnicity, and confounding in case-control association studies. Am J Hum Genet. 2005; 76 (2): 268–275. doi:10.1086/427888.Tang H., Quertermous T., Rodriguez B. et al. Genetic structure, selfidentified race/ethnicity, and confounding in case-control association studies. Am J Hum Genet. 2005; 76 (2): 268–275. doi:10.1086/427888.Balanovsky O., Petrushenko V., Mirzaev K. et al. Variation of genomic sites associated with severe Covid-19 across populations: global and national patterns. Pharmgenomics Pers Med. 2021; 14: 1391–1402. doi: 10.2147/PGPM.S320609.Balanovsky O., Petrushenko V., Mirzaev K. et al. Variation of genomic sites associated with severe Covid-19 across populations: global and national patterns. Pharmgenomics Pers Med. 2021; 14: 1391–1402. doi: 10.2147/PGPM.S320609.Fink-Baldauf I.M., Stuart W.D., Brewington J.J. et al. CRISPRi links COVID-19 GWAS loci to LZTFL1 and RAVER1. EBioMedicine. 2022; 75: 103806. doi: 10.1016/j.ebiom.2021.103806.Fink-Baldauf I.M., Stuart W.D., Brewington J.J. et al. CRISPRi links COVID-19 GWAS loci to LZTFL1 and RAVER1. EBioMedicine. 2022; 75: 103806. doi: 10.1016/j.ebiom.2021.103806.Zhao J., Yang Y., Huang H. et al. Relationship between the abo blood group and the coronavirus disease 2019 (COVID-19) susceptibility. Clin Infect Dis. 2021; 73 (2): 328–331. doi: 10.1093/cid/ciaa1150.Zhao J., Yang Y., Huang H. et al. Relationship between the abo blood group and the coronavirus disease 2019 (COVID-19) susceptibility. Clin Infect Dis. 2021; 73 (2): 328–331. doi: 10.1093/cid/ciaa1150.Zietz M., Zucker J., Tatonetti N.P. Associations between blood type and COVID-19 infection, intubation, and death. Nat Commun. 2020; 11 (1): 5761. doi: 10.1038/s41467-020-19623-x.Zietz M., Zucker J., Tatonetti N.P. Associations between blood type and COVID-19 infection, intubation, and death. Nat Commun. 2020; 11 (1): 5761. doi: 10.1038/s41467-020-19623-x.Steffen B.T., Pankow J.S., Lutsey P.L. et al. Proteomic profiling identifies novel proteins for genetic risk of severe COVID-19: the Atherosclerosis Risk in Communities Study. Hum Mol Genet. 2022; 31 (14): 2452–2461. doi: 10.1093/hmg/ddac024.Steffen B.T., Pankow J.S., Lutsey P.L. et al. Proteomic profiling identifies novel proteins for genetic risk of severe COVID-19: the Atherosclerosis Risk in Communities Study. Hum Mol Genet. 2022; 31 (14): 2452–2461. doi: 10.1093/hmg/ddac024.Murray G.P., Post S.R., Post G.R. ABO blood group is a determinant of von Willebrand factor protein levels in human pulmonary endothelial cells. J Clin Pathol. 2020; 73 (6): 347–349. doi: 10.1136/jclinpath-2019-206182.Murray G.P., Post S.R., Post G.R. ABO blood group is a determinant of von Willebrand factor protein levels in human pulmonary endothelial cells. J Clin Pathol. 2020; 73 (6): 347–349. doi: 10.1136/jclinpath-2019-206182.Valenti L., Griffini S., Lamorte G. et al. Chromosome 3 cluster rs11385942 variant links complement activation with severe COVID-19. J Autoimmun. 2021; 117: 102595. doi: 10.1016/j.jaut.2021.102595.Valenti L., Griffini S., Lamorte G. et al. Chromosome 3 cluster rs11385942 variant links complement activation with severe COVID-19. J Autoimmun. 2021; 117: 102595. doi: 10.1016/j.jaut.2021.102595.Орлова Е.А., Огарков О.Б., Хромова П.А. и др. Вариант rs657152 не ассоциируется с уровнем вирусной нагрузки при COVID-19 или вероятностью заболевания в популяции европеоидов Восточной Сибири. Генетика. 2021; 57 (8): 974–976. doi: https://doi.org/10.31857/ S0016675821080099.Orlova E.A., Ogarkov O.B., Khromova P.A. et al. SNP rs657152 Is not associated with the level of viral load in COVID-19 or the probability of disease in the population of caucasians in Eastern Siberia. Russ J Genet. 2021; 57 (8): 982–984]. doi: https://doi.org/10.31857/ S0016675821080099. (in Russian)Marçalo R., Neto S., Pinheiro M. et al. Evaluation of the genetic risk for COVID-19 outcomes in COPD and differences among worldwide populations. PLoS One. 2022; 17 (2): e0264009. doi: 10.1371/journal.pone. 0264009.Marçalo R., Neto S., Pinheiro M. et al. Evaluation of the genetic risk for COVID-19 outcomes in COPD and differences among worldwide populations. PLoS One. 2022; 17 (2): e0264009. doi: 10.1371/journal.pone. 0264009.Статистика распространения коронавируса в Республике Дагестан. URL: https://coronavirus-monitor.info/country/russia/respublika-dagestan/ (дата обращения 15.07.2023) [Statistika rasprostraneniya koronavirusa v Respublike Dagestan. URL: https://coronavirus-monitor.info/ country/russia/respublika-dagestan/ (data obrashcheniya 15.07.2023)Statistika rasprostraneniya koronavirusa v Respublike Dagestan. URL: https://coronavirus-monitor.info/ country/russia/respublika-dagestan/ (data obrashcheniya 15.07.2023)Национальная библиотека медицинских наук США. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs11385942/#frequency_tab (дата обращения 10.08.2023)Natsional'naya biblioteka meditsinskikh nauk SShA. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs11385942/#frequency_ tab (data obrashcheniya 10.08.2023)

The authors declare that there are no conflicts of interest present.