antibioticsАнтибиотики и ХимиотерапияAntibiot Khimioter = Antibiotics and Chemotherapy0235-2990ООО «Издательство ОКИ»10.24411/0235-2990-2019-100027antibiotics-138Research ArticleВ ПОМОЩЬ ПРАКТИКУЮЩЕМУ ВРАЧУGUIDELINES FOR PRACTITIONERSКлональная структура популяции изолятов Streptococcus pneumoniae, циркулирующих в России с 1980 по 2017 ггClonality of Streptococcus pneumoniae Isolates in Russia, Circulating from 1980 to 2017ЦветковаИ. А.TsvetkovaI. A.noemail@neicon.ruБелановС. С.BelanovS. S.noemail@neicon.ruГостевВ. В.GostevV. V.noemail@neicon.ruКалиногорскаяО. С.KalinogorskayaO. S.noemail@neicon.ruВолковаМ. О.VolkovaM. O.noemail@neicon.ruМоховА. С.MokhovA. S.noemail@neicon.ruНикитинаЕ. В.NikitinaE. V.noemail@neicon.ruКалисниковаЕ. Л.KalisnikovaE. L.noemail@neicon.ruИвановаК. А.IvanovaK. A.noemail@neicon.ruВолодинаА. А.VolodinaA. A.noemail@neicon.ruСидоренкоС. В.SidorenkoS. V.noemail@neicon.ruФедеральное государственное бюджетное учреждение «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства»РоссияFederal State Financed Institution Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases under the Federal Medical Biological AgencyRussian FederationУниверситет Хельсинки; Институт БиотехнологииРоссияUniversity of Helsinki; Institute of BiotechnologyRussian FederationСанкт Петербургский информационно-аналитический центрРоссияSaint Petersburg Information and Analytical CentreRussian FederationФГУП «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт вакцин и сывороток и предприятие по производству бактерийных препаратов Федерального медико-биологического агентства»РоссияSaint Petersburg Scientific Research Institute of Vaccines and Serums and the Enterprise for the Production of Bacterial Preparations of Federal Medical Biological AgencyRussian FederationФедеральное государственное бюджетное учреждение «Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства»; Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова» Минздрава РоссииРоссияFederal State Financed Institution Pediatric Research and Clinical Center for Infectious Diseases under the Federal Medical Biological Agency; North Western State Medical UniversityRussian Federation201906052020645-62231Copyright © Цветкова И.А., Беланов С.С., Гостев В.В., Калиногорская О.С., Волкова М.О., Мохов А.С., Никитина Е.В., Калисникова Е.Л., Иванова К.А., Володина А.А., Сидоренко С.В., 20202020Цветкова И.А., Беланов С.С., Гостев В.В., Калиногорская О.С., Волкова М.О., Мохов А.С., Никитина Е.В., Калисникова Е.Л., Иванова К.А., Володина А.А., Сидоренко С.В.Tsvetkova I.A., Belanov S.S., Gostev V.V., Kalinogorskaya O.S., Volkova M.O., Mokhov A.S., Nikitina E.V., Kalisnikova E.L., Ivanova K.A., Volodina A.A., Sidorenko S.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/article/view/138

Цель исследования - охарактеризовать популяцию Streptococcus pneumoniae, циркулирующих в России, выявить внутривидовую филогенетическую связь между штаммами пневмококков из разных географических мест. Материал и методы. Филогенетический анализ был проведён с помощью eBURST-анализа, а также анализа конкатенатов последовательностей шести генов домашнего хозяйства, используемых для мультилокусного сиквенстипирования (MLST). Результаты. Циркулирующие в России штаммы пневмококка, описанные в этом исследовании, связаны со многими успешными международными клонами, обладающими потенциалом для распространения. Выявлена тенденция к преимущественному распространению в России антибиотикорезистентности среди отдельных генетический линий.

The objective of this study was to clarify the intraspecies phylogenetic relationship between pneumococci strains from various geographical locations. Concatenated Multilocus sequence typing (MLST) sequences of six housekeeping genes were chosen for the phylogenetic tree construction. Trees, constructed for concatenated genes, revealed that there is a tendency for a clonal spread of antibiotic resistance. Interestingly, the isolates with novel or circulating mainly in Russia genotypes, described in this study, many are related to successful international clones, with the potential to spread.

филогенетический анализантибиотикорезистентностьStreptococcus pneumoniaeStreptococcus pneumoniaephylogenetic relationshipantibiotic resistanceReferences

The authors declare that there are no conflicts of interest present.