antibioticsАнтибиотики и ХимиотерапияAntibiot Khimioter = Antibiotics and Chemotherapy0235-2990ООО «Издательство ОКИ»antibiotics-326Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL PAPERSГенетические детерминанты устойчивости к антибактериальным средствам в нозокомиальных штаммах Escherichia coli, Klebsiella spp. и Enterobacter spp., выделенных в России в 2003-2007 ггGenetic Determinants of Antibacterial Resistance Among Nosocomial Escherichia coli Klebsiella spp., and Enterobacter spp. Isolates Collected in Russia within 2003-2007ПрямчукС. Д.PryamchukS. D.noemail@neicon.ruФурсоваН. К.FursovaN. K.noemail@neicon.ruАбаевИ. В.AbaevI. V.noemail@neicon.ruКовалевЮ. Н.KovalevYU. N.noemail@neicon.ruШишковаН. А.ShishkovaN. A.noemail@neicon.ruПечерскихЭ. И.PecherskikhE. I.noemail@neicon.ruКоробоваО. В.KorobovaO. V.noemail@neicon.ruАсташкинЕ. И.AstashkinE. I.noemail@neicon.ruПачкуновД. М.PachkunovD. M.noemail@neicon.ruКругловА. Н.KruglovA. N.noemail@neicon.ruИвановД. В.IvanovD. V.noemail@neicon.ruСидоренкоС. В.SidorenkoS. V.noemail@neicon.ruСветочЭ. А.SvetochE. A.noemail@neicon.ruДятловИ. А.DyatlovI. A.noemail@neicon.ruГосударственный научный центр Прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, ОболенскРоссияState Research Centre for Applied Microbiology and Biotechnology, ObolenskRussian FederationНациональное агентство клинической фармакологии и фармации, МоскваРоссияNational Agency for Clinical Pharmacology and Pharmacy, MoscowRussian FederationИнститут доклинической и клинической экспертизы лекарственных средств Росздравнадзора, МоскваРоссияInstitute for Preclinical and Clinical Drug Expertise, MoscowRussian FederationНаучно-исследовательский институт детских инфекций ФМБА, Санкт-ПетербургРоссияScientific Research Institute for Pediatric Infections, FMBA, St.PetersburgRussian Federation201013052020559-10310Copyright © ООО «Издательство ОКИ», 20202020ООО «Издательство ОКИ»ООО «Издательство ОКИ»https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/article/view/326

Клинические изоляты энтеробактерий, выделенные в 2003-2004 гг. (n=411) и в 2005-2007 гг. (n=422), имеют высокие уровни устойчивости к цефалоспоринам III-IV поколений, а также к антибактериальным средствам других групп (аминогликозидам, фторхинолонам, хлорамфениколу, ко-тримоксазолу). С помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) показано наличие в изолятах E.coli, Klebsiella spp. и Enterobacter spp. генов, кодирующих бета-лактамазы (БЛ) типов TEM, SHV, CTX-M, OXA и AmpC. Преобладающими ферментами являются БЛ CTX-M-типа, которые определены у 85% E.coli, 87% Klebsiella spp. и 38% Enterobacter spp. в первой коллекции; а также у 94% E.coli, 91% Klebsiella spp. и 38% Enterobacter spp. - во второй. Среди них идентифицированы гены, принадлежащие к трём подтипам: blaCTX-M-1 (228 blaCTX-M-15 и шесть bl®CTX-M-3 - в первой коллекции; 275 blOCTX-M-15, три blaCTX-M-3 и один blacτχ_M_22 - во второй), blaCTX-M-2 (один blaCTX-M-5 в первой коллекции; один blaCTX_M_2 - во второй), blaCTX_M_9 (17 blaCTX_M_14 и один blaCTX-M-9 в первой коллекции; семь blaCTX-M-14 и один blaCTX_M_9 - во второй). Три изолята в первой коллекции и один изолят во второй имели два гена разных кластеров - blaCTX-M-15 и blaCTX-M-14 - одновременно. Высокие уровни ассоциативной устойчивости изученных изолятов к ципрофлоксацину, ко-тримоксазолу, гентамицину, амикацину и хлорамфениколу связаны с наличием кассет устойчивости aadAl, aadA2, aadA5, aadB, aacA4, aac(6)Ib; dfrAl, dfrA5, dfrA12, dfrA17, cmlAl, ereA2 и catB8 в составе интегронов 1 класса, а также кассет устойчивости dfrA1, sat1 и aadA1 - в составе интегронов 2 класса.

Nosocomial bacterial Isolates collected within 2003-2004 (n=411) and 2005-2007 (n=422) were highly resistant to cephalosporins III-IV and antibacterials of other groups (aminoglycosides, fluoroquinolons, chloramphenicol, and co-trimoxazole). Genes encoding TEM, SHV, CTX-M, OXA-2, and AmpC types of beta-lactamases (BLs) in the E.coli, Klebsiella spp., and Enterobacter spp. isolates were detected using polymerase chain reaction (PCR). Prevalent CTX-M-type BLs were detected in 85% of the E.coli, 87% of the Klebsiella spp., and 38% of the Enterobacter spp. isolates of the first strain collection and in 94% of the E.coli, 91% of the Klebsiella spp., and 38% of the Enterobacter spp. isolates of the second one. Genes belonging to three subtypes of blaCTX-M genes were identified: blaCTX-M-1 (228 blaCTX-M-15 and six blaCTX-M-3 of the first strain collection; 275 blaCTX-M-15, three blaCTX-M-3, and one blaCTX-M-22 of the second one), blaCTX-M-2 (one blaCTX_M_5 of the first strain collection and one blaCTX-M-2 of the second one), blaCTX-M-9 (17 blaCTX-M-14 and one blaCTX-M-9 of the first strain collection; seven blaCTX-M-14 and one blaCTX-M-9 of the second one). Three isolates of the first strain collection and one isolate of the second one carried two genes belonging to two different subtypes i. e. blaCTX-M-15 and blaCTX-M-14 simultaneously. The bacterial isolates had high levels of associative resistance to ciprofloxacin, co-trimoxazole, gentamicin, amikacin, and chloramphenicol associated with the resistance gene cassettes aadA1, aadA2, aadA5, aadB, aacA4, aac(6)Ib; dfrA1, dfrA5, dfrA12, dfrA17, cmlA1, ereA2, and catB8 in the class 1 integrons and the resistance gene cassettes dfrA1, sat1, and aadA1 in the class 2 integrons.

нозокомиальные изолятыустойчивость к антибиотикамгены blaCTX_Mинтегроныгенные кассетыnosocomial isolatesantibacterial resistanceblaCTX_Mgenesintegronsgene cassettesReferencesPaterson D. L., Bonomo R. A. Extended-spectrum ß-lactamases: a clinical update. Clin Microbiol Rew 2005; 18: 4: 657-686.Paterson D. L., Bonomo R. A. Extended-spectrum ß-lactamases: a clinical update. Clin Microbiol Rew 2005; 18: 4: 657-686.Canton R., Novais A., Valverde A. et al. Prevalence and spread of extended -spectrum ß-lactamase-producing Enterobacteriaceae in Europe. Clin Microbiol Infect 2008; 14: 1: 144-153.Canton R., Novais A., Valverde A. et al. Prevalence and spread of extended -spectrum ß-lactamase-producing Enterobacteriaceae in Europe. Clin Microbiol Infect 2008; 14: 1: 144-153.Rossolini G. M., D'Andrea M. M., Mugnaioli C. The spread of CTX-Mtype extended-spectrum ß-lactamases. Ibid 2008; 14: 1: 33-41.Rossolini G. M., D'Andrea M. M., Mugnaioli C. The spread of CTX-Mtype extended-spectrum ß-lactamases. Ibid 2008; 14: 1: 33-41.Baraniak A., Fiett J., Sulikowska A., Hryniewicz W., Gniadkowski M. Countrywide spread of CxX-M-3 extended-spectrum beta-lactamaseproducing microorganisms of the family Enterobacteriaceae in Poland. Antimicrob Agents Chemother 2002; 46: 151-159.Baraniak A., Fiett J., Sulikowska A., Hryniewicz W., Gniadkowski M. Countrywide spread of CxX-M-3 extended-spectrum beta-lactamaseproducing microorganisms of the family Enterobacteriaceae in Poland. Antimicrob Agents Chemother 2002; 46: 151-159.Novais A., Canton R., Valverde A. et al. Dissemination and persistence of blaCTX-M-9 are linked to class 1 integrons containing CR1 associated with defective transposon derivatives from xn402 located in early antibiotic resistance plasmids of IncH12, IncP1-a, and IncFI groups. Ibid 2006; 50: 2741-2750.Novais A., Canton R., Valverde A. et al. Dissemination and persistence of blaCTX-M-9 are linked to class 1 integrons containing CR1 associated with defective transposon derivatives from xn402 located in early antibiotic resistance plasmids of IncH12, IncP1-a, and IncFI groups. Ibid 2006; 50: 2741-2750.Quinteros M., Radice M., Gardella N. et al. Extended-spectrum ß-lactamases in Enterobacteriaceae in Buenos Aires, Argentina, public hospitals. Ibid 2003; 47: 9: 2864-2867.Quinteros M., Radice M., Gardella N. et al. Extended-spectrum ß-lactamases in Enterobacteriaceae in Buenos Aires, Argentina, public hospitals. Ibid 2003; 47: 9: 2864-2867.Canton R., Coque T. M. The CTX-M ß-lactamase pandemic. Curr Opinion Microbiol 2006; 9: 466-475.Canton R., Coque T. M. The CTX-M ß-lactamase pandemic. Curr Opinion Microbiol 2006; 9: 466-475.Edelstein M., Pimkin M., Palagin I. et al. Prevalence and molecular epidemiology of CTX-M extended-spectrum ß-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Russian hospitals. Antimicrob Agents Chemother 2003; 47: 3724-3732.Edelstein M., Pimkin M., Palagin I. et al. Prevalence and molecular epidemiology of CTX-M extended-spectrum ß-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Russian hospitals. Antimicrob Agents Chemother 2003; 47: 3724-3732.Сидоренко C. В, Березин A. Г., Иванов Д. В. Молекулярные механизмы устойчивости грамотрицательных бактерий семейства Enterobacteriaceae к цефалоспориновым антибиотикам. Антибиотики и химиотер 2004; 49: 3: 3-13.Сидоренко C. В, Березин A. Г., Иванов Д. В. Молекулярные механизмы устойчивости грамотрицательных бактерий семейства Enterobacteriaceae к цефалоспориновым антибиотикам. Антибиотики и химиотер 2004; 49: 3: 3-13.Fursova N. K., Kruglov A. N., Abaev I. V. et al. Spreading of beta-lactamase genes among nosocomial isolates collected from Moscow clinics. Clin Microbiol Infect 2006; 12: 4: 1351.Fursova N. K., Kruglov A. N., Abaev I. V. et al. Spreading of beta-lactamase genes among nosocomial isolates collected from Moscow clinics. Clin Microbiol Infect 2006; 12: 4: 1351.NCCLS/CLSI. 2006. Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically, 5th ed. Document M7-A5. Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA.NCCLS/CLSI. 2006. Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically, 5th ed. Document M7-A5. Clinical and Laboratory Standards Institute, Wayne, PA.http://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/ Disk_test_documents/EUCAST_breakpoints_v1.0_20091221.pdfhttp://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/ Disk_test_documents/EUCAST_breakpoints_v1.0_20091221.pdfМетодические указания МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам». Утверждены Главным государственным санитарным врачом РФ Г.Г. Онищенко 04.03.2004 г.Методические указания МУК 4.2.1890-04 «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам». Утверждены Главным государственным санитарным врачом РФ Г.Г. Онищенко 04.03.2004 г.Эйдельштейн М. В. Выявление бета-лактамаз расширенного спектра у грамотрицательных бактерий с помощью фенотипических методов. Клин микробиол антимикроб химиотер 2001; 3: 2: 183-189.Эйдельштейн М. В. Выявление бета-лактамаз расширенного спектра у грамотрицательных бактерий с помощью фенотипических методов. Клин микробиол антимикроб химиотер 2001; 3: 2: 183-189.Rasheed J. K., Jay C., Metchock B., Berkowitz F. et al. Evolution of extended-spectrum beta-lactam resistance (SHV-8) in a strain of Escherichia coli during multiple episodes of bacteremia. Antimicrob Agents Chemother 1997; 41: 3: 647-653.Rasheed J. K., Jay C., Metchock B., Berkowitz F. et al. Evolution of extended-spectrum beta-lactam resistance (SHV-8) in a strain of Escherichia coli during multiple episodes of bacteremia. Antimicrob Agents Chemother 1997; 41: 3: 647-653.Oliver A., Weigel L. M., Rasheed J. K. et al. Mechanisms of decreased susceptibility to cefpodoxime in Escherichia coli. Antibiotics and Chemother 2002; 46(12): 3829-3836.Oliver A., Weigel L. M., Rasheed J. K. et al. Mechanisms of decreased susceptibility to cefpodoxime in Escherichia coli. Antibiotics and Chemother 2002; 46(12): 3829-3836.Pérez-Pérez F. J., Hanson N. D. Detection of plasmid-mediated AmpC beta-lactamase genes in clinical isolates by using multiplex PCR. J Clin Microbiol 2002; 40: 2153-2162.Pérez-Pérez F. J., Hanson N. D. Detection of plasmid-mediated AmpC beta-lactamase genes in clinical isolates by using multiplex PCR. J Clin Microbiol 2002; 40: 2153-2162.Robicsek A., Strahilevitz J., Sahm D. F. et al. qnr Prevalence in ceftazidime-resistant Enterobacteriaceae isolates from the United States. Antimicrob Agents Chemother 2006; 50: 8: 2872-2874.Robicsek A., Strahilevitz J., Sahm D. F. et al. qnr Prevalence in ceftazidime-resistant Enterobacteriaceae isolates from the United States. Antimicrob Agents Chemother 2006; 50: 8: 2872-2874.Machado E., Cantón R., Baquero F. et al. Integron content of extended-spectrum-beta-lactamase-producing Escherichia coli strains over 12 years in a single hospital in Madrid, Spain. Ibid 2005; 49: 5: 1823-1829.Machado E., Cantón R., Baquero F. et al. Integron content of extended-spectrum-beta-lactamase-producing Escherichia coli strains over 12 years in a single hospital in Madrid, Spain. Ibid 2005; 49: 5: 1823-1829.Skurnik D., Le Menac'h A., Zurakowski D. et al. Integron-associated antibiotic resistance and phylogenetic grouping of Escherichia coli isolates from healthy subjects free of recent antibiotic exposure. Ibid 2005; 49: 7: 3062-3065.Skurnik D., Le Menac'h A., Zurakowski D. et al. Integron-associated antibiotic resistance and phylogenetic grouping of Escherichia coli isolates from healthy subjects free of recent antibiotic exposure. Ibid 2005; 49: 7: 3062-3065.Jiang X., Ni Y., Jiang Y., Yuan F. et al. Outbreak of infection caused by Enterobacter cloacae producing the novel VEB-3 beta-lactamase in China. J Clin Microbiol 2005; 43: 2: 826-831.Jiang X., Ni Y., Jiang Y., Yuan F. et al. Outbreak of infection caused by Enterobacter cloacae producing the novel VEB-3 beta-lactamase in China. J Clin Microbiol 2005; 43: 2: 826-831.Amber R. P. The structure of ß-lactamases. Philos Trans R Soc Lond (Biol.) 1980; 289: 321-331.Amber R. P. The structure of ß-lactamases. Philos Trans R Soc Lond (Biol.) 1980; 289: 321-331.Fernandez-Cuenca F., Rodriguez-Martinez J. M., Martinez-Martinez L., Pascual A. In vivo selection of Enterobacter aerogenes with reduced susceptibility to cefepime and carbapenems associated with decreased expression of a 40 kDa outer membrane protein and hyperproduction of AmpC beta-lactamase. Int J Antimicrob Agents 2006; 27: 6: 549-552.Fernandez-Cuenca F., Rodriguez-Martinez J. M., Martinez-Martinez L., Pascual A. In vivo selection of Enterobacter aerogenes with reduced susceptibility to cefepime and carbapenems associated with decreased expression of a 40 kDa outer membrane protein and hyperproduction of AmpC beta-lactamase. Int J Antimicrob Agents 2006; 27: 6: 549-552.Rodriguez-Martinez J. M., Velasco C., Garcia Iet al. Mutant prevention concentrations of fluoroquinolones for Enterobacteriaceae expressing the plasmid-carried quinolone resistance determinant qnrA1. Antimicrob Agents Chemother. 2007; 51: 6: 2236-2239.Rodriguez-Martinez J. M., Velasco C., Garcia Iet al. Mutant prevention concentrations of fluoroquinolones for Enterobacteriaceae expressing the plasmid-carried quinolone resistance determinant qnrA1. Antimicrob Agents Chemother. 2007; 51: 6: 2236-2239.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.