<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">antibiotics</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Антибиотики и Химиотерапия</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Antibiot Khimioter = Antibiotics and Chemotherapy</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">0235-2990</issn><publisher><publisher-name>ООО «Издательство ОКИ»</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.37489/0235-2990-2021-66-9-10-24-29</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">antibiotics-856</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>КЛИНИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРАКТИКА</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>GUIDELINES FOR PRACTITIONERS</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Генетические различия штаммов Helicobacter pylori, выделенных у больных хроническим гастритом лёгкого и тяжёлого течения</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Genetic differences between Helicobacter pylori strains isolated from patients with chronic mild and severe gastritis</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9203-5857</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Голубкина</surname><given-names>Е. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Golubkina</surname><given-names>E. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Голубкина Елена Вадимовна — к. м. н., доцент кафедры клинической фармакологии</p><p>eLIBRARY SPIN-код: 1410-3092</p><p>Астрахань</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena V. Golubkina — Ph. D. in medicine</p><p>eLIBRARY SPIN-код: 1410-3092</p><p>Astrakhan</p></bio><email xlink:type="simple">kamnevy@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1835-1496</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Сорокин</surname><given-names>В. М.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Sorokin</surname><given-names>V. M.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Сорокин Владимир Михайлович — к. б. н., старший научный сотрудник, лаборатории туляремии</p><p>Scopus: 7201463407</p><p>Ростов-на-Дону</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vladimir M. Sorokin — Ph. D. in biology</p><p>Scopus: 7201463407</p><p>Rostov-on-Don</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-6725-8290</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Левитан</surname><given-names>Б. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Levitan</surname><given-names>B. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Левитан Болеслав Наумович — д. м. н., профессор, заведующий кафедрой факультетской терапии и профессиональных болезней с курсом последипломного образования</p><p>Scopus ID: 7003706105</p><p>Астрахань</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Boleslav N. Levitan — D. Sc. in medicine, Professor</p><p>Scopus ID: 7003706105</p><p>Astrakhan</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3129-2443</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Умерова</surname><given-names>А. Р.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Umerova</surname><given-names>A. R.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Умерова Аделя Равильевна — д. м. н., доцент, заведующая кафедрой клинической фармакологии</p><p>Астрахань</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Adelya R. Umerova — D. Sc. in medicine</p><p>Astrakhan</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-4453-8614</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Камнева</surname><given-names>Н. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kamneva</surname><given-names>N. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Камнева Наталия Вячеславовна — д. м. н., доцент кафедры пропедевтики внутренних болезней</p><p>Астрахань</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Natalia V. Kamneva — D. Sc. in medicine</p><p>Astrakhan</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ ВО «Астраханский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Astrakhan State Medical University of the Ministry of Health of the Russian Federation</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Rostov-on-Don Plague Control Research Institute of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2021</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>02</day><month>01</month><year>2022</year></pub-date><volume>66</volume><issue>9-10</issue><fpage>24</fpage><lpage>29</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; ООО «Издательство ОКИ», 2022</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">ООО «Издательство ОКИ»</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">ООО «Издательство ОКИ»</copyright-holder><license xlink:href="https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/about/submissions#copyrightNotice" xlink:type="simple"><license-p>https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/about/submissions#copyrightNotice</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/article/view/856">https://www.antibiotics-chemotherapy.ru/jour/article/view/856</self-uri><abstract><sec><title>Актуальность</title><p>Актуальность. Хеликобактерные хронические гастриты (ХГ), будучи весьма неоднородной группой, до сих пор не имеют деления на основе данных генотипирования Helicobacter pylori (Нр), по которым можно было бы прогнозировать клиническую форму ХГ.</p></sec><sec><title>Цель</title><p>Цель. Поиск превалирования cagA гена или какой-либо аллельной комбинации vacA гена, или устойчивых сочетаний cagA и какой-либо аллельной комбинации vacA в изолятах Нр от больных лёгкой и тяжёлой формой ХГ и больных язвенной болезнью (ЯБ).</p></sec><sec><title>Методы</title><p>Методы. Изоляты Нр из гастробиоптатов генотипировали по cagA и аллельным комбинациям vacA (s1m1, s2m1, s1m2, s2m2). Различие по встречаемости аллельных комбинаций vacA оценивали по Манну–Уитни; сцеплённость cagA и аллельных комбинаций vacA оценивали по величине коэффициента корреляции Спирмена (rs).</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. Ген сagA обнаруживался более, чем в половине всех случаев как у больных ЯБ, так и у больных ХГ (лёгкое и тяжёлое течение). Встречаемость vacAs1m1 (самая вирулентная аллельная комбинация) достоверно не отличалась при всех формах гастритов и при ЯБ; корреляция между cagA и vacAs1m1 была достоверной во всех группах больных, rs от 0,57 до 0,72. У больных ХГ лёгкого течения наблюдалось обилие невирулентной аллельной комбинации vacAs2m2, достоверно отличающейся от встречаемости её как у больных ХГ тяжёлого течения, так и у больных ЯБ; совместная встречаемость vacAs2m2 и cagA у больных ХГ лёгкого течения была хаотичной (rs=–0,13; p=0,40).</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. При лёгком течении ХГ, несмотря на отсутствие достоверных различий по cagA и vacAs1m1 (если сравнивать с тяжёлым течением ХГ и ЯБ), достоверно доминировали штаммы с невирулентной аллельной комбинацией vacAs2m2; следовательно, обнаружение именно этой аллельной комбинации vacA говорит в пользу лёгкого течения ХГ.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Background</title><p>Background. Helicobacter pylori-associated chronic gastritis (CG), being a very heterogeneous group, still does not have a divisin based on Helicobacter pylori (Hp) genotyping data, which could predict the clinical form of CG.</p><p>The aim of the study is to search for the prevalence of the cagA gene or any allelic combination of the vacA gene, or stable combinations of cagA and any allelic combination of vacA genes in Hp isolates from patients with mild and severe CG, as well as patients with peptic ulcer disease (PUD).</p></sec><sec><title>Methods</title><p>Methods. Hp isolates from gastrobiopsy specimens were genotyped for cagA and vacA allelic combinations (s1m1, s2m1, s1m2, s2m2). The difference in the occurrence of vacA allelic combinations was assessed by Mann–Whitney U test; the conjunction of cagA and vacA allelic combinations was assessed by the Spearman's rank correlation coefficient (rs).</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. The cagA gene was found in more than half of all cases, both in patients with ulcer and in patients with CG (mild and severe). The incidence of vacAs1m1 (the most virulent allelic combination) showed no significant differences in all forms of gastritis and in PUD; the correlation between cagA and vacAs1m1 was significant in all groups of patients, rs ranged from 0.57 to 0.72. In patients with mild CG, an abundance of non-virulent allelic combination vacAs2m2 was observed, which was significantly different from its occurrence both in patients with severe CG and in patients with ulcer; the joint occurrence of vacAs2m2 and cagA in patients with mild CG was chaotic (rs=-0.13; P=0.40).</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion. In mild CG, despite the absence of significant differences in cagA and vacAs1m1 (when compared with severe CG and ulcer disease), strains with a non-virulent allelic combination vacAs2m2 were significantly dominant; therefore, the detection of this particular allelic combination of vacA speaks in favor of a mild course of CG.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>хронический гастрит</kwd><kwd>язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки</kwd><kwd>Helicobacter pylori</kwd><kwd>cagA ген</kwd><kwd>аллельные комбинации vacA гена</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>chronic gastritis</kwd><kwd>peptic ulcer of the stomach and duodenum</kwd><kwd>Helicobacter pylori</kwd><kwd>cagA gene</kwd><kwd>allelic combinations of the vacA gene</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Хеликобактериоз. Под ред. В. А. Исакова, И. В. Домарадского. М.: Медпрактика-М, 2003.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Khelikobakterioz. V. A. Isakova, I. V. Domaradskogo (ed.). Moscow: Medpraktika-M, 2003. (In Russian)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Сорокин В.М., Писанов Р.В., Водопьянов А.С., Голубкина Е.В., Березняк Е.А. Сравнительный анализ генотипов штаммов Helicobacter pylori в Ростовской и Астраханской областях. Медицинский вестник Юга России. 2018; 9 (4): 81–86. doi: 10.21886/2219–8075–2018–9–4–81–86.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sorokin V.M., Pisanov R.V., Vodop'yanov A.S., Golubkina E.V., Bereznyak E.A. Sravnitel'nyi analiz genotipov shtammov Helicobacter pylori v Rostovskoi i Astrakhanskoi oblastyakh. Meditsinskii Vestnik Yuga Rossii. 2018; 9 (4):81– 86. doi: 10.21886/2219–8075–2018–9–4–81–86. (in Russian)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Котеров А.Н., Ушенкова Л.Н., Зубенкова Э.С., Калинина М.В., Бирюков А.П., Ласточкина Е.М. и др. Сила связи. Сообщение 2. Градации величины корреляции. Медицинская радиология и радиационная безопасность. 2019; 64 (6): 12–24. doi: 10.12737/1024-6177-2019-64-6-12-24.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Koterov A.N., Ushenkova L.N., Zubenkova E.S., Kalinina M.V., Biryukov A.P., Lastochkina E.M. i dr. Sila svyazi. Soobshchenie 2. Gradatsii velichiny korrelyatsii. Meditsinskaya Radiologiya i Radiatsionnaya Bezopasnost. 2019; 64 (6): 12–24. doi: 10.12737/1024-6177-2019-64-6-12-24. (in Russian)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Березняк Е.А., Сорокин В.М., Карпова И.О., Ступина Н.А., Терентьев А.Н. Особенности генотипов штаммов Helicobacter pylori, циркулирующих в Ростовской области. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2013; 4 (71).</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bereznyak E.A., Sorokin V.M., Karpova I.O., Stupina N.A., Terent'ev A.N. Osobennosti genotipov shtammov Helicobacter pylori, tsirkuliruyushchikh v Rostovskoi oblasti. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2013; 4 (71). (in Russian)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Орлов С.В., Калашникова В.А., Барышникова Н.В., Успенский Ю.П. Генетические особенности инфекции Helicobacter pylori у низших приматов и человека. Дневник Казанской медицинской школы. 2015; 1: 15–21.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Orlov S.V., Kalashnikova V.A., Baryshnikova N.V., Uspenskii Yu.P. Geneticheskie osobennosti infektsii Helicobacter pylori u nizshikh primatov i cheloveka. Dnevnik Kazanskoi Meditsinskoi Shkoly. 2015; 1:15–21. (in Russian)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Нижевич А.А., Ахмадеева Э. Н., Кучина Е. С., Туйгунов М. М., Сатаев В. У. Региональные генотипы Helicobacter pylori среди детей с гастродуоденальными заболеваниями в республике Башкортостан. Медицинский вестник Юга России. 2013; 2: 94–97.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Nizhevich A.A., Akhmadeeva E. N., Kuchina E. S., Tuigunov M. M., Sataev V. U. Regional-'nye genotipy Helicobacter pylori sredi detei s gastroduodenal'nymi zabolevaniyami v respublike Bashkortostan. Meditsinskii Vestnik Yuga Rossii. 2013; 2: 94–97. (in Russian)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Голубкина Е.В., Сорокин В.М., Левитан Б.Н., Умерова А.Р., Камнева Н.В. Эрадикация, сохранение штамма, смена штамма — исходы антихеликобактерной терапии. Антибиотики и химиотер. 2021; 66 (3–4): 18–26. doi: 10.37489/0235-2990-2021-66-3-4-18-26.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Golubkina E.V., Sorokin V.M., Levitan B.N., Umerova A.R., Kamneva N.V. Eradikatsiya, sokhranenie shtamma, smena shtamma — iskhody antikhelikobakternoi terapii. Antibiotiki i khimioter. 2021; 66 (3–4): 18–26. doi: 10.37489/0235-2990-2021-66-3-4-18-26. (in Russian)</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
