Структурный полиморфизм геномных островов, кодирующих резистентность к бета-лактамным антибиотикам, у коагулазонегативных стафилококков, выделенных в стационарах Российской Федерации

Коагулазонегативные стафилококки (coagulase-negative staphylococci - CoNS) рассматриваются как резервуар мобильных генетических элементов и, в первую очередь, стафилококковой хромосомной кассеты (staphylococcal cassette chromosome mec - SCCmec), определяющей устойчивость стафилококков к бета-лактамным антибиотикам. Среди 95 изолятов, выделенных в различных регионах Российской Федерации, были SCCmec кассеты II, IV, IVa, V, VII и VIII типов. Выявлены также кассеты подтипов CIa, CIb, CIc и CI (комплекс mec класса B, и два комплекса рекомбиназ ccrl и ccr2). Выявлены и другие типы кассет, содержащие комплексы mec классов A, C1 и С2 в сочетании с различными генами рекомбиназ. У изолятов S.epidermidis преобладали кассеты, несущие комплекс mec B, а у изолятов S.haemolyticus присутствовали кассеты, несущие комплекс mec классов C1 и C2. Из 9 изолятов S.hominis - пять несли новый тип кассет: комплекс mec класса A в сочетании с комплексом генов рекомбиназ ccrl. Не удалось идентифицировать SCCmec у представителей S.capitis и S.pasteuri. У представителей этих видов были выявлены либо комплекс mec (S.pasteuri - 1 изолят), либо комплексы рекомбиназ S.capitis (2 изолята). Выявленные у CoNS варианты SCCmec могут служить источником для формирования новых генетических линий метициллинорезистентных S.aureus (MRSA).

коагулазонегативные стафилококки, устойчивость к метициллину, стафилококковая хромосомная кассета SCCmec

1. Fairbrother R.W. Coagulase production as a criterion for the classification of the staphylococci. J Pathol Bacteriol 1940; 50: 1: 83-88.

2. Becker K., Heilmann C., Peters G. Coagulase-negative staphylococci. Clin Microbiol Rev 2014; 27: 4: 870-926.

3. Piette A., Verschraegen G. Role of coagulase-negative staphylococci in human disease. Vet Microbiol 2009; 134: 1-2: 45-54.

4. Otto M. Staphylococcus epidermidis - the ‘accidental’ pathogen. Nat Rev Microbiol 2009; 7: 8: 555-567.

5. Otto M. Molecular basis of Staphylococcus epidermidis infections. Semin Immunopathol 2012; 34: 2: 201-214.

6. Krediet T.G., Mascini E.M., van Rooij E., Vlooswijk J., Paauw A., Gerards L.J., Fleer A. Molecular epidemiology of coagulase-negative staphylococci causing sepsis in a neonatal intensive care unit over an 11-year period. J Clin Microbiol 2004; 42: 3: 992-995.

7. Cheung G.Y., Otto M. Understanding the significance of Staphylococcus epidermidis bacteremia in babies and children. Curr Opin Infect Dis 2010; 23: 3: 208-216.

8. Kjellander J.O., Klein J.O., Finland M. In Vitro Activity of Penicillins against Staphylococcus albus. Proc Soc Exp Biol Med 1963; 113: 1023-1031.

9. Ito T., Hiramatsu K., Tomasz A., de Lencastre H., Perreten V., Holden M.T.G., Coleman D.C., Goering R., Giffard P.M., Skov R.L. et al: Guidelines for reporting novel mecA gene homologues. Antimicrobial Agents and Chemotherapy 2012; 56: 10: 4997-4999.

10. Shore A.C., Coleman D.C. Staphylococcal cassette chromosome mec: recent advances and new insights. Int J Med Microbiol 2013; 303: 6-7: 350-359.

11. Методические указания по определению чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. Методические указания МУК 4 2 1890-04 2004.

12. CLSI.: Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Twenty-Fourth Informational Supplement. CLSI document M100-S24. In. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2014.

13. Воронина О.Л., Кунда M.C., Дмитренко O.A., Любасовская Л.А., Ковалишена О.В., Попов Д.А. Оценка видового разнообразия коагулазоотрицательных стафилококков, выделенных в стационарах Российской Федерации в 2009-2010 гг. Журн микробиол эпидем иммунол 2011; 1: 3-8.

14. Kondo Y., Ito T., Ma X.X., Watanabe S., Kreiswirth B.N., Etienne J., Hiramatsu K. Combination of multiplex PCRs for staphylococcal cassette chromosome mec type assignment: rapid identification system for mec, ccr, and major differences in junkyard regions. Antimicrob Agents Chemother 2007; 51: 1: 264-274.

15. Ruppe E., Barbier F., Mesli Y., Maiga A., Cojocaru R., Benkhalfat M., Benchouk S., Hassaine H., Maiga I., Diallo A. et al. Diversity of staphylococcal cassette chromosome mec structures in methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus haemolyticus strains among outpatients from four countries. Antimicrobial Agents Chemother 2009; 53: 2: 442-449.

16. Stegger M., Andersen P.S., Kearns A., Pichon B., Holmes M.A., Edwards G., Laurent F., Teale C., Skov R., Larsen A.R. Rapid detection, differentiation and typing of methicillin-resistant Staphylococcus aureus harbouring either mecA or the new mecA homologue mecA (LGA251). Clin Microbiol Infect 2012; 18: 4: 395-400.

17. Дмитренко O.A. Молекулярно-генетические аспекты эпидемиологии внутрибольничных инфекций, вызванных представителями вида Staphylococcus aureus, устойчивыми к метициллину/оксациллину. М.: 2008.

18. Milheirico C., Oliveira D.C., de Lencastre H. Multiplex PCR strategy for subtyping the staphylococcal cassette chromosome mec type IV in methicillin-resistant Staphylococcus aureus: ‘SCCmec IV multiplex’. J Antimicrob Chemother 2007; 60: 1: 42-48.

19. Ruppe E., Barbier F., Mesli Y., Maiga A., Cojocaru R., Benkhalfat M., Benchouk S., Hassaine H., Maiga I., Diallo A. et al. Diversity of staphylococcal cassette chromosome mec structures in methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus haemolyticus strains among outpatients from four countries. Antimicrob Agents Chemother 2009; 53: 2: 442-449.

20. Svensson K., Hellmark B., Soderquist B. Characterization of SCCmec elements in methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis isolated from blood cultures from neonates during three decades. APMIS 2011; 119: 12: 885-893.

21. Zong Z. Characterization of a complex context containing mecA but lacking genes encoding cassette chromosome recombinases in Staphylococcus haemolyticus. BMC Microbiol 2013; 13: 64.

22. Гостев В.В. Метициллинорезистентные золотистые стафилококки: проблема распространения в мире и России. Фарматека 2015; 6: 30-38.

23. Дмитренко O.A., Шагинян И.А., Прохоров В.Я., Матвеев C.M., Аляпкина Ю.С., Ванюшева О.В., Шилов И.А., Лунин В.Г. Исследование полиморфизма коагулазного гена методом секвенирования у метициллинорезистентных штаммов Staphylococccus aureus, выделенных в стационараз различных регионов России и Беларуси. Журн микробиол, эпидемиол иммунобиол 2005; 3: 27-32.

24. Романов А.В., Чернов Е.А. Молекулярная эпидемиология внутрибольничных золотистых стафилококков в стационарах различных регионов России. Молекуляр мед 2013; 4: 55-64.

25. Lindsay J.A. Staphylococcus aureus genomics and the impact of horizontal gene transfer. Int J Med Microbiol 2014; 304: 2: 103-109.

26. Zhang K., McClure J.A., Elsayed S., Conly J.M. Novel staphylococcal cassette chromosome mec type, tentatively designated type VIII, harboring class A mec and type 4 ccr gene complexes in a Canadian epidemic strain of methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2009; 53: 2: 531-540.

27. Chatterjee S.S., Chen L., Joo H.S., Cheung G.Y., Kreiswirth B.N., Otto M. Distribution and regulation of the mobile genetic element-encoded phenol-soluble modulin PSM-mec in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. PLoS One 2011; 6: 12: e28781.

28. Bouchami O., Ben Hassen A., de Lencastre H., Miragaia M. High prevalence of mec complex C and ccrC is independent of SCCmec type V in Staphylococcus haemolyticus. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2012; 31: 4: 605-614.

29. Ito T., Okuma K., Ma X.X., Yuzawa H., Hiramatsu K. Insights on antibiotic resistance of Staphylococcus aureus from its whole genome: genomic island SCC. Drug Resist Updat 2003; 6: 1: 41-52.