Preview

Антибиотики и Химиотерапия

Расширенный поиск

Обнаружение генетических маркеров резистентности к β-лактамным антибиотикам у грамотрицательных микроорганизмов с помощью ПЦР-диагностики

Аннотация

В исследование включены образцы биологического материала (15 образцов гемокультуры и 89 образцов бронхоальвеолярного лаважа), из которого были выделены монокультуры грамотрицательных бактерий устойчивых к цефотаксиму, цефепиму, имипенему, меропенему. В отобранных образцах методом ПЦР с детекцией результатов в режиме реального времени (ПЦР-тест систем ООО НПФ «Литех») были обнаружены гены бета-лактамаз: bla/CTX- M-like(72/104, 69,2%), blaNDM (6/104, 5,8%), blaVIM (49/104, 47,1%) и blaOXA48_like (59/104, 56,7%). Выявлена корреляция между фенотипом устойчивости Acinetobacter spp., Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae и Escherichia coli к цефотаксиму и карбапенемным антибиотикам и выявлением генов blaCTX_M_like и blaNDM. В то же время до 70% K.pneumoniae, выделенных из биологических образцов, положительных на наличие генов карбапенемаз blaVIM и blaOXA48-like демонстрировали фенотипическую чувствительность к карбапенемам. Полученные результаты подтверждают прогностические возможности генетической диагностики для улучшения традиционного бактериологического исследования.

Об авторах

Е. С. Лисицына
НПФ «Литех»
Россия


Т. В. Черненькая
НИИ скорой помощи им. Н.В. Склифосовского
Россия


Е. Н. Ильина
НИИ физико-химической медицины ФМБА России
Россия


И. В. Лазарева
НИИ детских инфекций ФМБА России
Россия


В. А. Агеевец
НИИ детских инфекций ФМБА России
Россия


С. В. Сидоренко
НИИ детских инфекций ФМБА России
Россия


Список литературы

1. Dellinger R.P., Levy M.M., Rhodes A., Annane D., Gerlach H., Opal S.M., Sevransky J.E., Sprung C.L., Douglas I.S., Jaeschke R. et al. Surviving sepsis campaign: international guidelines for management of severe sepsis and septic shock: 2012. Crit Care Med 2013; 41: 2: 580-637.

2. Bush K., Jacoby G.A. Updated functional classification of {beta}-lacta-mases. Antimicrob Agents Chemother 2010; 54: 3: 969-976.

3. Lynch J.P., 3rd, Clark N.M., Zhanel G.G. Evolution of antimicrobial resistance among Enterobacteriaceae (focus on extended spectrum beta-lactamases and carbapenemases). Expert Opin Pharmacother 2013; 14: 2: 199-210.

4. Livermore D.M., Canton R., Gniadkowski M., Nordmann P., Rossolini G.M., Arlet G., Ayala J, Coque T.M., Kern-Zdanowicz I, Luzzaro F. et al. CTX-M: changing the face of ESBLs in Europe. J Antimicrob Chemother 2007; 59: 2: 165-174.

5. Edelstein M., Pimkin M., Palagin I., Edelstein I., Stratchounski L. Prevalence and molecular epidemiology of CTX-M extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Russian hospitals. Antimicrob Agents Chemother 2003; 47: 12: 3724-3732.

6. Canton R., Akova M., Carmeli Y., Giske C.G., Glupczynski Y., Gniadkowski M., Livermore D.M., Miriagou V., Naas T., Rossolini G.M. et al. Rapid evolution and spread of carbapenemases among Enterobacteriaceae in Europe. Clin Microbiol Infect 2012; 18: 5: 413-431.

7. Albiger B., Glasner C., Struelens M., Grundmann H., Monnet D., group tESoC-PEEw. May 2015. Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in Europe: assessment by national experts from 38 countries. Euro Surveill 2015; 20 (45): pii=30062 DOI: http://dxdoiorg/102807/1560-7917ES20152045300622015.

8. Ageevets V.A., Partina I.V., Lisitsyna E.S., Ilina E.N., Lobzin Y.V., Shlyapnikov S.A., Sidorenko S.V. Emergence of carbapenemase-produc-ing Gram-negative bacteria in Saint Petersburg, Russia. Int J Antimicrob Agents 2014; 44: 2: 152-155.

9. Hakenbeck R., Martin C., Dowson C., Grebe T.Penicillin-binding protein 2b of Streptococcus pneumoniae in piperacillin-resistant laboratory mutants. J Bacteriol 1994, 176: 17: 5574-5577.

10. Oueslati S., Nordmann P., Poirel L. Heterogeneous hydrolytic features for OXA-48-like beta-lactamases. J Antimicrob Chemother 2015; 70: 4: 1059-1063.

11. Edelstein M.V., Skleenova E.N., Shevchenko O.V., D'Souza J. W., Tapalski D.V., Azizov I.S., Sukhorukova M.V., Pavlukov R.A., Kozlov R.S., Toleman M.A. et al. Spread of extensively resistant VIM-2-positive ST235 Pseudomonas aeruginosa in Belarus, Kazakhstan, and Russia: a longitudinal epidemiological and clinical study. Lancet Infect Dis 2013; 13: 10: 867-876.

12. CLSI.: Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. Twenty-Fourth Informational Supplement. CLSI document M100-S24. In. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2014.

13. Lupo A., Papp-Wallace K.M., Sendi P., Bonomo R.A., Endimiani A. Nonphenotypic tests to detect and characterize antibiotic resistance mechanisms in Enterobacteriaceae. Diagn Microbiol Infect Dis 2013; 77: 3: 179-194.

14. Cuzon G., Naas T., Bogaerts P., Glupczynski Y., Nordmann P. Evaluation of a DNA microarray for the rapid detection of extended-spectrum betalactamases (TEM, SHV and CTX-M), plasmid-mediated cephalosporinases (CMY-2-like, DHA, FOX, ACC-1, ACT/MIR and CMY-1-like/MOX) and carbapenemases (KPC, OXA-48, VIM, IMP and NDM). J Antimicrob Chemother 2012; 67: 8: 1865-1869.

15. Avlami A., Bekris S., Ganteris G., Kraniotaki E., Malamou-Lada E., Orfanidou M., Paniara O., Pantazatou A., Papagiannitsis C.C., Platsouka E. et al. Detection of metallo-beta-lactamase genes in clinical specimens by a commercial multiplex PCR system. J Microbiol Methods 2010; 83: 2: 185-187.

16. Cuzon G., Naas T., Bogaerts P., Glupczynski Y., Nordmann P. Probe ligation and real-time detection of KPC, OXA-48, VIM, IMP, and NDM carbapenemase genes. Diagn Microbiol Infect Dis 2013; 76: 4: 502-505.

17. Spanu T., Fori B., D'Inzeo T., Canu G., Campoli S., Giani T, Palucci I., Tumbarello M., Sanguinetti M., Rossolini G.M. Evaluation of the New NucliSENS EasyQ KPC test for rapid detection of Klebsiella pneumoniae carbapenemase genes (blaKPC). J Clin Microbiol 2012; 50: 8: 2783-2785.

18. Willemsen I., Hille L., Vrolijk A., Bergmans A., Kluytmans J. Evaluation of a commercial real-time PCR for the detection of extended spectrum beta-lactamase genes. J Med Microbiol 2014, 63: Pt 4: 540-543.

19. Uno N., Suzuki H., Yamakawa H., Yamada M., Yaguchi Y., Notake S., Tamai K., Yanagisawa H., Misawa S., Yanagihara K. Multicenter evaluation of the Verigene Gram-negative blood culture nucleic acid test for rapid detection of bacteria and resistance determinants in positive blood cultures. Diagn Microbiol Infect Dis 2015; 83: 4: 344-348.


Рецензия

Для цитирования:


Лисицына Е.С., Черненькая Т.В., Ильина Е.Н., Лазарева И.В., Агеевец В.А., Сидоренко С.В. Обнаружение генетических маркеров резистентности к β-лактамным антибиотикам у грамотрицательных микроорганизмов с помощью ПЦР-диагностики. Антибиотики и Химиотерапия. 2015;60(9-10):17-22.

For citation:


Lisitsina E.S., Chernenkaya T.V., Ilyina E.N., Lazareva I.V., Ageevets V.A., Sidorenko S.V. Discovery of Genetic Markers of Resistance to β-Lactams in Gramnegative Microorganisms by PCR Diagnosis. Antibiot Khimioter = Antibiotics and Chemotherapy. 2015;60(9-10):17-22. (In Russ.)

Просмотров: 472


ISSN 0235-2990 (Print)