Анализ устойчивости к антибактериальным препаратам холерных вибрионов, выделенных из объектов окружающей среды в России в 2019 г.
https://doi.org/10.37489/0235-2990-2021-66-3-4-4-11
Аннотация
Цель исследования — анализ резистентности к антибактериальным препаратам штаммов Vibrio cholerae, выделенных из водных объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2019 г. В работе использовали штаммы V.cholerae О1 El Tor (14) и V.cholerae nonO1/nonO139. Чувствительность/устойчивость к 11 антибактериальным препаратам определяли методом серийных разведений в плотной питательной среде. Наличие генов лекарственной устойчивости определяли с помощью ПЦР в формате реального времени. Обнаружены колебания чувствительности/устойчивости V.cholerae в разные годы. Фенотипическая устойчивость штаммов к тетрациклину и триметоприму/ сульфаметоксазолу коррелировала с наличием в них генов tetR и dfrA1. В штаммах V.cholerae, содержащих гены tetR, qnrVC1, присутствие ICE не выявлено. Вариабельность и широкий спектр устойчивости V.cholerae требуют пристального внимания к проблеме антибиотикорезистентности холеры. Обнаружение ICE в изученных штаммах V.cholerae, а также генов антибиотикорезистентности, не связанных с ICE элементами, подчеркивают необходимость молекулярно-генетического мониторинга антибиотикорезистентности V.cholerae.
Об авторах
Н. А. Селянская
Ростовский-на-Дону противочумный институт
Россия
Россия
Селянская Надежда Александровна — к. м. н., старший научный сотрудник, и. о. зав. лабораторией экспериментально-биологических моделей
ул. М. Горького, 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002
Л. А. Егиазарян
Ростовский-на-Дону противочумный институт
Россия
Россия
Егиазарян Лиана Альбертовна — младший научный сотрудник лаборатории биологической безопасности и лечения ООИ
Ростов-на-Дону
М. И. Ежова
Ростовский-на-Дону противочумный институт
Россия
Россия
Ежова Мария Ивановна — младший научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры
Ростов-на-Дону
Н. И. Пасюкова
Ростовский-на-Дону противочумный институт
Россия
Россия
Пасюкова Нина Ивановна — научный сотрудник лаборатории экспериментально-биологических моделей
Ростов-на-Дону
С. О. Водопьянов
Ростовский-на-Дону противочумный институт
Россия
Россия
Водопьянов Сергей Олегович — д. м. н., ведущий научный сотрудник, и.о. зав. лабораторией биохимии микробов
Ростов-на-Дону
Список литературы
1. Распоряжение Правительства РФ № 2045-р об утверждении Стратегии предупреждения распространения антимикробной резистентности в Российской Федерации на период до 2030 года. М.: 25 сентября 2017 г.
2. Распоряжение Правительства РФ № 604-р об утверждении плана мероприятий на 2019–2024 годы по реализации Стратегии предупреждения распространения антимикробной резистентности в Российской Федерации на период до 2030 года. М.: 30 марта 2019 г.
3. Рыжко И.В., Шутько А.Г., Дудина Н.А., Цураева Р.И., Щербанюк А.И., Молдаван И.А., Люкшина Е.Ю. Влияние нетрансмиссивных и трансмиссивных маркёров резистентности холерного вибриона биотипа эльтор на экспрессию R-плазмид incC и incJ групп несовместимости. Холера. Мат. IX Российской научно-практической конференции по проблеме «Холера». Ростов-на-Дону, 2004; 75–77.
4. Шутько А.Г., Дудина Н.А., Рыжко И.В., Ломов Ю.М., Цураева Р.И. Экспрессия R-плазмид различных групп несовместимости в клетках штаммов холерного вибриона eltor. Новые технол. в профилакт., эпиднадзоре и леч. инфекц. забол. Мат. науч. конф., посвящ. 85-л. со дня рожд. акад. РАМН И. Н. Блохиной. Под ред. проф. Е. И. Ефимова, Н.Новгород: Изд-во ННГУ им. Н. И. Лобачевского, 2006; 140–141.
5. Подшивалова М.В., Кузютина Ю.А., Захарова И.Б., Лопастейская Я.А., Викторов Д.В. Характеристика антибиотикорезистентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT-типа. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014; 3.: 34—39.
6. Фадеева А.В., Ерошенко Г.А., Шавина Н.Ю., Кутырев В.В. Анализ SXT констина антибиотикочувствительного штамма Vibrio choleraе не О1/не О139 серогруппы. Проблемы особо опасных инфекций. 2012; 113: 102.
7. Aminov R.I, Mackie R.I. Evolution and ecology of antibiotic resistance genes. FEMS Microbiology Letters. 2007; 271–2: 147–161.
8. Rodriguez-Blanco A., Lemos M., Osorio C. Integrating conjugative elements as vectors of antibiotic, mercury, and quaternary ammonium compound resistance in marine aquaculture environments. Antimicrob Agents Chemother. 2012; 56 (5): 2619–2626.
9. Carraro N., Rivard N., Ceccarelli D., Colwell R.R., Burrus V. IncA/C Conjugative Plasmids Mobilize a New Family of Multidrug Resistance Islands in Clinical Vibrio cholerae Non-O1/Non-O139 Isolates from Haiti. MBio. 2016; 7(4). e00509-16.Published online 2016 Jul 19. doi: 10.1128/mBio.00509-16.
10. Березняк Е.А., Тришина А.В., Селянская Н.А., Архангельская И.В., Симонова И.Р., Ежова М.М. Антибиотикочувствительность штаммов V.cholerae non O1 / non O139, изолированных из гидроэкосистем в 2016–2017 гг. ЖМЭИ. 2019; 2: 87–91.
11. Baron S., Larvor E., Chevalier S., Jouy E., Kempf I., Granier S. A., Lesne J. Antimicrobial Susceptibility among Urban Wastewater and Wild Shellfish Isolates of non-O1/non-O139 Vibrio cholerae from La Rance Estuary (Brittany, France). Front Microbiol. 2017; 8: 1637. doi: 10.3389/fmicb.2017.01637.
12. Dua P., Karmakar A., Ghosh C. Virulence gene profiles, biofilm formation, and antimicrobial resistance of Vibrio cholerae non-O1/non-O139 bacteria isolated from West Bengal, India. Heliyon. 2018 Dec; 4 (12): e01040. doi: 10.1016/j.heliyon.2018.e01040.
13. Akoachere J.T.K., Mbuntcha C.K.P. Water sources as reservoirs of Vibrio cholerae O1 and non-O1 strains in Bepanda, Douala (Cameroon): relationship between isolation and physico-chemical factors. BMC Infect Dis. 2014; 14: 421.
14. Abana D., Gyamf E.i, Dogbe M., Opoku G., Opare D., Boateng G., Mosi L. Investigating the virulence genes and antibiotic susceptibility patterns of Vibrio cholerae O1 in environmental and clinical isolates in Accra, Ghana BMC Infect Dis. 2019; 19: 76. Published online 2019 Jan 21. doi: 10.1186/s12879-019-3714-z.
15. Weill F.X., Domman D., Njamkepo E. et al. Quilici Genomic insights into the 2016–2017 cholera epidemic in Yemen. Nature. 2019 Jan; 565 (7738): 230–233. doi: 10.1038/s41586-018-0818-3.
16. Хайтович А.Б. Чувствительность к антибиотикам холерных вибрионов О1, выделенных от людей. Антибиотики и химиотерапия. 1998; 3: 14–18.
17. Семиотрочев В.Л., Ривкус Ю.З. Классификация заболеваний, вызываемых микроорганизмами рода Vibrio. Здоровье населения и среда обитания. 2012; 2: 32–36.
18. Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Ежова М.И. Анализ динамики выделения штаммов холерных вибрионов из объектов окружающей среды на территории российской федерации с 1989 по 2016 гг. с помощью авторской ГИС. Вестник Пермского Университета. Серия: биология. 2017; 1: 112–117.
19. Левченко Д.А., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Ежова М.И., Москвитина Э.А., Титова С.В. Анализ результатов мониторинга холерных вибрионов в объектах окружающей среды на административных территориях России с помощью ГИС «Холера 1989–2014». Проблемы особо опасных инфекций. 2017; 4: 99–102.
20. Селянская Н.А., Березняк Е.А., Егиазарян Л.А., Тришина А.В., Архангельская И.В., Веркина Л.М., Симонова И.Р. База данных «Фенотипы антибиотикорезистентности холерных вибрионов различных серогрупп, выделенных на территории Ростовской области». Свидетельство о государственной регистрации №2018620078 от 12.01.2018. М.: Роспатент, 2018.
21. Селянская Н.А., Водопьянов А.С., Веркина Л.М. База данных «Антибиотикорезистентность клинических штаммов холерных вибрионов». Свидетельство о государственной регистрации № 2015621001 от 30.06.15. М.: Роспатент, 2015.
22. Селянская Н.А., Водопьянов А.С., Егиазарян Л.А., Веркина Л.М. Геоинформационная система «Антибиотикорезистентность холерных вибрионов Эль Тор, выделенных на территории Российской Федерации (2005–2016 гг.)». Свидетельство о государственной регистрации №2017621246 от 27.10.2017. М.: Роспатент, 2017.
23. Методические указания 4.2.2495-09 Определение чувствительности возбудителей опасных бактериальных инфекций (чума, сибирская язва, холера, туляремия, бруцеллёз, сап, мелиоидоз) к антибактериальным препаратам. М.: 2009: 59.
24. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Олейников И.П., Мишанькин Б.Н., Кругликов В.Д., Архангельская И.В., Зубкова Д.А., Ежова М.И. INDEL- и VNTR-типирование штаммов Vibrio cholerae, выделенных в 2013 году из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации. Здоровье населения и среда обитания. 2015; 5 (266): 41–44.
25. Spagnoletti M., Ceccarelli D., Colombo M.M. Rapid detection by multiplex PCR of Genomic Islands, prophages and Integrative Conjugative Elements in V.cholerae 7 th pandemic variants. J Microbiol Methods. 2012; 88 (1): 98–102.
26. Крицкий А.А., Челдышова Л.Б., Заднова С.П., Плеханов Н.А., Смирнова Н.И. Способ одновременного выявления штаммов Vibrio cholerae и определения в их геноме генов лекарственной устойчивости с помощью ПЦР в режиме реального времени. Биотехнология. 2018; 34: 2: 70–72.
27. Гржибовский А.М. Доверительные интервалы для частот и долей. Экология человека. 2008; 5: 57–60.
28. Селянская Н.А., Егиазарян Л.А., Тришина А.В., Березняк Е.А., Симонова И.Р. Антибиотикорезистентность Vibrio cholerae El Tor, изолированных из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации. Здоровье населения и среда обитания. 2019;. 3: 61–64.
29. Егиазарян Л.А., Селянская Н.А., Захарова И.Б., Подшивалова М.В., Березняк Е.А., Веркина Л.М., Тришина А.В. Антибиотикорезистентность холерных вибрионов Эль Тор, выделенных на территории Российской Федерации в 2006–2015 гг. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2017; 22 (1): 25–30.
30. Рыжко И.В., Дудина Н.А., Ломов Ю.М., Шутько А.Г., Цураева Р.И., Анисимов Б.И. Антибактериальная активность 22 препаратов в отношении штаммов холерного вибриона О1 и О139 серогрупп, выделенных от людей в период с 1927 по 2005 гг. Антибиотики и химиотерапия. 2005; 8–9: 38–42.
31. Дудина Н.А., Шутько А.Г., Рыжко И.В., Цураева Р.И., Молдаван И.А. Сравнительная оценка активности антибактериальных препаратов in vitro и при экспериментальной холере у белых мышей, вызванной штаммами холерного вибриона О1 и О139 серогруппы. Антибиотики и химиотерапия. 2004; 11: 23–27.
32. Rijal N., Acharya J., Adhikari Sh., Upadhaya B. Psd, Shakya G., P.Kansakar, Rajbhandari P. Changing epidemiology and antimicrobial resistance in Vibrio cholerae: AMR surveillance findings (2006–2016) from Nepal. BMC Infect Dis. 2019; 19: 801.
33. Тришина А.В., Березняк Е.А., Архангельская И.В., Симонова И.Р., Ренгач М.В. Чувствительность к антибактериальным препаратам холерных вибрионов не О1 / не О139 серогрупп, выделенных из водных объектов г. Ростова-на-Дону. Холера и патоген. для человека вибрионы: сборник статей Проблемной комиссии. Ростов-на-Дону, 2019; Вып.32: 121–124.
34. Селянская Н.А., Рыжко И.В., Веркина Л.М., Тришина А.В., Миронова А.В. Индукция in vitro трансмиссивной устойчивости к тетрациклину, левомицетину и ампициллину у культур Vibrio cholerae не О1/ не О139 серогрупп, выделенных в 1990–2005 гг. Антибиотики и химиотерапия. 2011; 56 (7–8): 16–21.
35. Shah M.R., Nur A.H., Alam М., Sadique A., Sultana M., Hoq Md. M., Sack R.B., Colwell R.R. Vibrio cholerae O1 with Reduced Susceptibility to Ciprofloxacin and Azithromycin Isolated from a Rural Coastal Area of Bangladesh. Front. Microbiol. 2017. doi: 10.3389/fmicb.2017.00252.
36. Ceccarell D., Spagnoletti M., Hasan N.A., Lansingd S., Huqa A., Colwell R.R. A new integrative conjugative element detected in Haitian isolates of Vibrio cholerae non-O1/non-O139. Res Microbiol. 2013; 164 (9): 891–893.
Рецензия
Для цитирования:
Селянская Н.А., Егиазарян Л.А., Ежова М.И., Пасюкова Н.И., Водопьянов С.О. Анализ устойчивости к антибактериальным препаратам холерных вибрионов, выделенных из объектов окружающей среды в России в 2019 г. Антибиотики и Химиотерапия. 2021;66(3-4):4-11. https://doi.org/10.37489/0235-2990-2021-66-3-4-4-11
For citation:
Selyanskaya N.A., Egiazaryan L.A., Ezhova M.I., Pasyukova N.I., Vodopyanov S.O. Analysis of Antibiotic Resistance of Vibrio Сholerae Isolated From Environmental Objects in Russia in 2019. Antibiotics and Chemotherapy. 2021;66(3-4):4-11. (In Russ.) https://doi.org/10.37489/0235-2990-2021-66-3-4-4-11
Просмотров: 461
Послать статью по эл. почте 