Видовое разнообразие и маркеры резистентности дрожжей рода Candida у коронапозитивных и коронанегативных больных с внебольничными пневмониями

Актуальность. При новой коронавирусной инфекции на фоне снижения иммунного статуса пациентов и массивной антибактериальной терапии возрастает риск присоединения грибковой коинфекции, что приводит к осложнению течения основного заболевания и повышает риск неблагоприятного исхода. Поэтому для выбора адекватной схемы лечения больного необходимым является не только идентификация всех ассоциантов, вызывающих инфекционный процесс, но и обязательное определение их чувствительности к антибактериальным и противогрибковым препаратам.

Цель. Изучение видового состава грибковых ассоциантов у коронапозитивных и коронанегативных пациентов с внебольничными пневмониями (ВП) и определение спектра чувствительности/устойчивости дрожжей и дрожжепобных грибов к антимикотическим препаратам.

Материал и методы. Исследован видовой состав грибковой микрофлоры в образцах мокроты от 723 пациентов с ВП, поступивших из ЛПО г. Ростова-на-Дону. Идентификацию выделенных культур проводили с помощью бактериологического и масс-спектрометрического методов. Чувствительность дрожжей к антимикотическим препаратам определяли диско-диффузионным методом.

Результаты. Установлено, что в образцах мокроты у пациентов с ВП в 31–32% случаев присутствуют дрожжи и дрожжеподобные грибы в этиологически значимых количествах. Выявлено 10 различных видов дрожжей и дрожжеподобных грибов. Превалирующим видом по количеству изолированных культур являлся Candida albicans (83%). При повторном исследовании коронапозитивных пациентов после их пребывании в стационаре выявлена тенденция к увеличению количества и интенсивности проявления кандидозных поражений. Более того, зарегистрирована смена видов кандид, что влечёт за собой изменение их чувствительности к противогрибковым препаратам. Результаты определения чувствительности грибов к антимикотикам показали высокий процент штаммов, устойчивых к флуконазолу.

Заключение. Полученные данные демонстрируют, что дрожжи и дрожжеподобные грибы являются доминирующими ассоциантами при осложнённых формах внебольничных пневмоний. В этой связи целесообразным представляется индивидуальное микробиологическое сопровождение больного в процессе его лечения с идентификацией всех возбудителей.

1. Kathuria S., Singh P.K., Sharma C., Prakash A., Masih A., Kumar A. et al. Multidrug-resistant Candida auris misidentified as Candida haemulonii: characterization by matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight mass spectrometry and DNA sequencing and its antifungal susceptibility profile variability by Vitek 2, CLSI broth microdilution, and Etest method. J Clin Microbiol. 2015; 53 (6): 1823–1830. doi: 10.1128/JCM.00367-15.

2. Иванов А.А., Куличенко Т.В. Candida auris: проблемы диагностики и лечения. Вопросы современной педиатрии. 2020; 19 (1): 20–25. doi: 10.15690/vsp.v19i1.2081.

3. Багирова Н.С., Дмитриева Н.В. Резистентность Candida spp. к амфотерицину B у онкологических больных. Журнал инфектологии. 2016; 8 (1): 26–31

4. Delavy M., Dos Santos A.R., Heiman C.M., Coste A.T. Investigating antifungal susceptibility in Candida species with MALDI-TOF MS-Based Assays. Fron Cell Infect Microbiol. 2019; 9 (19): 1–8. doi: 10.3389/fcimb.2019.00019.

5. Pote S.T., Sonawane M.S., Rahi P., Shah S.R., Shouche Y.S., Patole M.S. et al. Distribution of Pathogenic Yeasts in Different Clinical Samples: Their Identification, Antifungal Susceptibility Pattern, and Cell Invasion. Infect Drug Resist. 2020; 13: 1133–1145. doi: 10.2147/IDR.S238002.

6. Kal Çakmaklıoğulları E., Aşgın N., Değerli K. A comparison of the costs, reliability and time of result periods of widely used methods, new molecular methods and MALDI TOF-MS in the routine diagnosis of Candida strains. Mikrobiyol Bul. 2019; 53 (2): 204–212. doi: 10.5578/mb.67952.

7. Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Котова В.О., Бутакова Л.В., Базыкина Е.А. Характеристика бактериальной микрофлоры, выделенной из проб мокроты больных пневмонией в Хабаровске и Хабаровском крае в начальный период пандемии Covid-19 (май-июнь 2020 г.). Проблемы ООИ. 2020; (3): 43–49. doi: 10.21055/0370-1069-2020-3-43-49.

8. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В., Чемисова О.С. и др. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. Проблемы ООИ. 2020; (4): 99–105. doi: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105.

9. Павлович Н.В., Цимбалистова М.В., Аронова Н.В., Анисимова А.С., Водопьянов С.О., Водопьянов А.С. и др. Внебольничные пневмонии бактериальной этиологии и спектр чувствительности возбудителей к антибиотикам у коронапозитивных и коронанегативных больных. Антибиотики и химиотер. 2021; 66 (1–2): 26–32. doi: 10.37489/0235-2990-2021-66-1-2-26-32.

10. Arastehfar A., Carvalho A., van de Veerdonk F.L., Jerey D. Jenks, Koehler P., Krause R. et al. COVID-19 Associated Pulmonary Aspergillosis (CAPA) – from immunology to treatment. J Fungi (Basel). 2020; 6 (2): 91. doi: 10.3390/jof6020091.

11. Sen M., Lahane S., Lahane T.P., Parekh R., Honavar S.G. Mucor in a Viral Land: A Tale of Two Pathogens. Indian J Ophthalmol. 2021; 69 (2): 244–252. doi: 10.4103/ijo.IJO_3774_20.

12. Лабораторная диагностика внебольничных пневмоний: Методические указания МУК 4.2.3115-13. М.: 2013.

13. Мороз А.Ф., Снегирёва А.Е. Грибы рода Candida (Методы выделения, идентификации на видовом уровне и определение чувствительности к противогрибковым препаратам). Методические рекомендации. М.: НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМН, 2009.

14. Чеботарь И.В., Поликарпова С.В., Бочарова Ю.А., Маянский Н.А. Использование времяпролетной масс-спектрометрии с матричноактивированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TОF MS) для идентификации бактериальных и грибковых возбудителей III—IV групп патогенности. Лабораторная служба. 2018; 7 (2): 78–86. doi: 10.17116/labs20187278-86.

15. Сахарук Н.А., Козловская В.В. Кандидоз: этиология, клиника, диагностика, лечение. Витебск: ВГМУ, 2010; 192.

16. Серов В.Н., Буралкина Н.А., Борисенко М.Ю., Мамедова Ф.Ш. Клиническая эффективность флуконазола в лечении вульвовагинального кандидоза. Медицинский Совет. 2016; 2: 60–63. doi: 10.21518/2079-701X-2016-2-60-63.

17. Межевитинова Е.А., Абакарова П.Р., Погосян Ш.М. Применение флуконазола у женщин репродуктивного возраста с вульвовагинальным кандидозом. Медицинский Совет. 2018; 13: 96–102. doi: 10.21518/2079-701X-2018-13-96-102.