Генотипы и носительство генов β-лактамаз у карбапенеморезистентных штаммов Acinetobacter baumannii, выделенных в г. Москве

Цель. Определить механизмы резистентности к карбапенемам у штаммов Acinetobacter baumannii и дать их клональную характеристику путём мультилокусного сиквенс-типирования. Материал и методы. Охарактеризованы карбапенеморезистентные (карба-Р) изоляты A.baumannii, выделенные у пациентов отделений реанимации и интенсивной терапии и хирургического профиля трёх стационаров г. Москвы в 2012-2015 гг. Чувствительность к карбапенемам определяли методом Е-тестов. Определение сиквенс-типов (ST) проводили путём мультилокусного сиквенс-типирования (МЛСТ) с использованием стандартных протоколов по схемам Oxford и Pasteur. Детекцию генов β-лактамаз проводили при помощи ПЦР. Результаты. Всего исследовали 88 карба-Р A.baumannii. МЛСТ по схеме Oxford (^Oxf) выявило 15 сиквенс-типов, которые принадлежали к трём клональным комплексам (СС): СС92^М (69%), СС944°^хf (30%) и СС109 (1%). CC944^Oxf включал ST944^Oxf (n=16) и два впервые описанных однолокусных варианта этого сиквенс-типа - ST1103^Oxf (n=3) и ST1104^Oxf (n=7); все три сиквенс-типа были идентичны ST78 по МЛСТ-схеме Pasteur (^Pas). Все изоляты A.baumannii, относившиеся к СС944^Oxf/ST78^Pas (n=26), были носителями гена OXA-40-подобной карбапенемазы blaOXA-72, и все, за исключением одного, обладали геном 0-лактамазы расширенного спектра из группы CTX-M b/a_CTX__M_₁₁₅. ST944^Oxf был единственным сиквенс-типом, присутствовавшим во всех трёх стационарах. Заключение. Наши данные показывают доминирование двух клональных линий среди карба-Р A.baumannii в г. Москве. Одна из них, включающая носителей b/a_OXA-72 и b/a_CTX__M_₁₁₅ из CC944^Oxf/ST78^Pas, может быть клоном, эндемичным для России.

устойчивость к антибиотикам, карбапенемазы, МЛСТ, клональный комплекс

1. Carretto E., Barbarini D., Dijkshoorn L., van der Reijden T.J., Brisse S., V. Passet, Farina C. Widespread carbapenem resistant Acinetobacter baumannii clones in Italian hospitals revealed by a multicenter study. Infect Genet Evol 2011; 11: 1319-1326.

2. Da Silva G.J., Quinteira S., Bertolo E., Sousa J.C., Gallego L., Duarte A., Peixe L. Long-term dissemination of an OXA-40 carbapenemase-producing Acinetobacter baumannii clone in the Iberian Peninsula. J Antimicrob Chemother 2004; 54: 255-258.

3. Di Popolo A., Giannouli M., Triassi M., Brisse S., Zarrilli R. Molecular epidemiological investigation of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strains in four Mediterranean countries with a multilocus sequence typing scheme. Clin Microbiol Infect 2011; 17: 197-201.

4. Munoz-Price L.S., Arheart K., Nordmann P., Boulanger A.E., Cleary T., Alvarez R., Pizano L., Namias N., Kett D.H., Poirel L. Eighteen years of experience with Acinetobacter baumannii in a tertiary care hospital. Crit Care Med 2013; 41: 2733-2742.

5. Principe L., Piazza A., Giani T., Bracco S., Caltagirone M.S., Arena F., Nucleo E., Tammaro F., Rossolini G.M., Pagani L., Luzzaro F. Epidemic diffusion of OXA-23-producing Acinetobacter baumannii isolates in Italy: results of the first cross-sectional countrywide survey. J Clin Microbiol 2014; 52: 3004-3010.

6. Vincent J.L., Rello J., Marshall J., Silva E., Anzueto A., Martin C.D., Moreno R., Lipman J., Gomersall C., Sakr Y., Reinhart K. 2009. International study of the prevalence and outcomes of infection in intensive care units. JAMA 2009; 302: 2323-2329.

7. Villalon P., Valdezate S., Cabezas T., Ortega M., Garrido N., Vindel A., Medina-Pascual M.J., Saez-Nieto J.A. Endemic and epidemic Acinetobacter baumannii clones: a twelve-year study in a tertiary care hospital. BMC Microbiol 2015; 15 :47.

8. Fournier P.E, Richet H. The epidemiology and control of Acinetobacter baumannii in health care facilities. Clin Infect Dis 2006; 42: 692-699.

9. Lolans K., Rice T.W., Munoz-Price L.S., Quinn J.P. Multicity outbreak of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates producing the carbapenemase OXA-40. Antimicrob. Agents Chemother. 2006; 50: 2941-2945.

10. Da Silva G.J., Domingues S. Insights on the horizontal gene transfer of carbapenemase determinants in the opportunistic pathogen Acinetobacter baumannii. Microorganisms 2016; 4 (3)pii: E29.

11. Potron A., Poirel L., Nordmann P. Emerging broad-spectrum resistance in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii: Mechanisms and epidemiology. Int J Antimicrob Agents 2015; 45: 568-585.

12. Karah N., Sundsfjord A., Towner K., Samuelsen 0. Insights into the global molecular epidemiology of carbapenem non-susceptible clones of Acinetobacter baumannii. Drug Resist Updat 2012; 15: 237-247.

13. Zarrilli R., Pournaras S., Giannouli M., Tsakris A. Global evolution of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii clonal lineages. Int J Antimicrob Agents 2013; 41: 11-19.

14. Acinetobacter baumannii MLST - база данных, http://pubmlst.org/abau-mannii/.

15. Giannouli M., Antunes L.C., Marchetti V., Triassi M., Visca P., Zarrilli R. Virulence-related traits of epidemic Acinetobacter baumannii strains belonging to the international clonal lineages I-III and to the emerging genotypes ST25 and ST78. BMC Infect Dis 2013; 13: 282.

16. Longo F., Vuotto C., Donelli G. Biofilm formation in Acinetobacter baumannii. New Microbiol 2014; 37: 119-127.

17. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иватик Н.В., Тимохова А.В., Дехнич А.В. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011-2012 гг. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2014. - Т. 16. - № 4. - C. 266-272.

18. Pfeifer Y., Hunfeld K.P., Borgmann S., Maneg D., Blobner W., Werner G., Higgins P.G. Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii ST78 with OXA-72 carbapenemase and ESBL gene blaCTX-M-115. J. Antimicrob Chemother 2016; 71: 1426-1428.

19. Solomennyi A., Goncharov A., Zueva L. Extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii belonging to the international clonal lineage I in a Russian burn intensive care unit. Int. J Antimicrob Agents 2015; 45: 525-528.

20. Edelstein M., Pimkin M., Palagin I., Edelstein I., Stratchounski L. Prevalence and molecular epidemiology of CTX-M extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Russian hospitals. Antimicrob Agents Chemother 2003; 47: 3724.

21. Woodford N., Ellington M.J., Coelho J.M., Turton J.F., Ward M.E., Brown S., Amyes S.G., Livermore D.M. Multiplex PCR for genes encoding prevalent OXA carbapenemases in Acinetobacter spp. Int J Antimicrob Agents 2006; 27 (4): 351-353.

22. Giannouli M., Cuccurullo S., Crivaro V., Di Popolo A., Bernardo M., Tomasone F., Amato G., Brisse S., Triassi M., Utili R., Zarrilli R. Molecular epidemiology of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii in a tertiary care hospital in Naples, Italy, shows the emergence of a novel epidemic clone. J Clin Microbiol 2010; 48: 1223-1230.

23. Mammina C., Bonura C., Aleo A., Calà C., Caputo G., Cataldo M.C., Di Benedetto A., Distefano S., Fasciana T., Labisi M., Sodano C., Palma D.M., Giammanco A. Characterization of Acinetobacter baumannii from intensive care units and home care patients in Palermo, Italy. Clin Microbiol Infect 2011; 17: E12-15.

24. Vali L., Dashti K., Opazo-Capurro A.F., Dashti A.A., Al Obaid K., Evans B.A. Diversity of multi-drug resistant Acinetobacter baumannii population in a major hospital in Kuwait. Front Microbiol 2015; 6: 743.

25. Mosqueda N., Gato E., Roca I., Lopez M., de Alegria C.R, Fernandez Cuenca F., Martinez-Martinez L., Pachon J., Cisneros J.M., Rodriguez-Bano J. Characterization of plasmids carrying the blaOXA-24/40