Preview

Антибиотики и Химиотерапия

Расширенный поиск

Полиморфизм генов, участвующих в сборке клеточной стенки у метициллинорезистентных Staphylococcus aureus со сниженной чувствительностью к ванкомицину

Полный текст:

Аннотация

Проблема формирования и распространения изолятов S.aureus со сниженной чувствительностью к ванкомицину (Vancomycin intermediate S.aureus, VISA) ограничивает использование этого антибиотика для терапии инфекций, вызванных MRSA. Процесс формирования такого фенотипа сложный и связан с накоплением мутаций в генах, участвующих в биосинтезе клеточной стенки. В работе бышо проведено геномное секвенирование семи изолятов, имеющих разную чувствительность к ванкомицину и относящихся к одной генетической линии: ST8 - t008 - SCCmec IVc. Проведённый популяционный анализ для изолятов со сниженной чувствительностью к ванкомицину не выявил hVISA/VISA фенотипов, при этом PAP/AUC составил 0,53-0,7. Сравнение 83% core - частей геномов изолятов с МПК 1 мкг/мл и МПК 2 мкг/мл, а также контрольных геномов (NCBI GenBank) с известной чувствительностью, вышвило разную кластеризацию, при этом изоляты с МПК 2 мкг/мл локализовались в одном кластере. Сравнение нуклеотидного конкатената, составленного из 44 генов, участвующих в сборке клеточной стенки, также показало, что изоляты кластеризуются в один кластер. Быыи выявлены уникальные мутации для изолятов с МПК 2 мкг/мл в murZ (T353A), rpoB (Y946C) и fdh2 (G446S). Таким образом, изоляты со сниженной чувствительностью к ванкомицину не обладали фенотипом hVISA или VISA. Однако, выявленные мутации в «ключевыгх» генах биосинтеза пептидогликана могут свидетельствовать о начальном этапе селекции устойчивости к ванкомицину с формированием pre - hVISA.

Об авторах

В. В. Гостев
Детский научно-клинический центр инфекционных болезней; Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова
Россия


О. С. Калиногорская
Детский научно-клинический центр инфекционных болезней
Россия


С. М. Юдин
Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
Россия


О. А. Дмитренко
Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н. Ф. Гамалеи
Россия


А. В. Кудрявцева
Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН
Россия


С. В. Сидоренко
Детский научно-клинический центр инфекционных болезней; Северо-Западный государственный медицинский университет им. И. И. Мечникова
Россия


Список литературы

1. Chang S., Sievert D.M., Hageman J.C., Boulton M.L., Tenover F.C., Downes F.P., Shah S., Rudrik J.T., Pupp G.R., Brown W.J. et al. Infection with vancomycin-resistant Staphylococcus aureus containing the vanA resistance gene. N Engl J Med 2003; 348 (14): 1342-1347.

2. Courvalin P. Vancomycin resistance in gram-positive cocci. Clin Infect Dis 2006; 42: Suppl 1: S25-34.

3. Hiramatsu K., Kayayama Y., Matsuo M., Aiba Y., Saito M., Hishinuma T., Iwamoto A. Vancomycin-intermediate resistance in Staphylococcus aureus. J Glob Antimicrob Resist 2014; 2 (4): 213-224.

4. Casapao A.M., Davis S.L., McRoberts J.P., Lagnf A.M., Patel S., Kullar R., Levine D.P., Rybak M.J. Evaluation of vancomycin population susceptibility analysis profile as a predictor of outcomes for patients with infective endocarditis due to methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2014; 58 (8): 4636-4641.

5. van Hal S.J., Lodise T.P., Paterson D.L. The clinical significance of vancomycin minimum inhibitory concentration in Staphylococcus aureus infections: a systematic review and meta-analysis. Clin Infect Dis 2012; 54 (6): 755-771.

6. Hu Q., Peng H., Rao X. Molecular Events for Promotion of Vancomycin Resistance in Vancomycin Intermediate Staphylococcus aureus. Front Microbiol 2016; 7: 1601.

7. Katayama Y., Azechi T., Miyazaki M., Takata T., Sekine M., Matsui H., Hanaki H., Yahara K., Sasano H., Asakura K. et al. Prevalence of Slow-Growth Vancomycin Nonsusceptibility in Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2017; 61 (11).

8. Saito M., Katayama Y., Hishinuma T., Iwamoto A., Aiba Y., Kuwahara-Arai K., Cui L., Matsuo M., Aritaka N., Hiramatsu K. «Slow VISA», a novel phenotype of vancomycin resistance, found in vitro in heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus strain Mu3. Antimicrob Agents Chemother 2014; 58 (9): 5024-5035.

9. Сухорукова М.В., Cклеенова Е.Ю., Иватик H.B., Тимохова А.В., Эйдельштейн М.В, Дехнич А.В., Козлов Р.С., ПоповД.А., Астанина М.А., Жданова О.А. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования Марафон в 2011-2012 гг. КМАХ. - 2014. - Т. 16. - № 4. - C. 280-286

10. Гостев В.В., Калиногорская О.С., Попенко Л.Н., Черненькая Т.В., Науменко З.С., Ворошилова Т.М., Захарова Ю.А., Хохлова О.Е., Круглов А.Н., Ершова М.Г., Молчанова И.В., Сидоренко С.В. Антибиотикорезистентность метициллинорезистентных штаммов Staphylococcus aureus, циркулирующих в Российской Федерации. Антибиотики и химиотер. - 2015. - 60. - № 1-2. - C. 3-9

11. Романов А.В., Дехнич А.В., Сухорукова М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Эйдельштейн М.В., Козлов Р.С., Попов Д.А. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Staphylococcus aureus в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования Марафон в 2013-2014 гг. КМАХ. - 2017. -Т. 19. - № 1. - C. 57-62

12. Wootton M., Howe R.A., Hillman R., Walsh T.R., Bennett P.M., MacGowan A.P. A modified population analysis profile (PAP) method to detect hetero-resistance to vancomycin in Staphylococcus aureus in a UK hospital. J Antimicrob Chemother 2001; 47 (4): 399-403.

13. Bankevich A., Nurk S., Antipov D., Gurevich A.A., Dvorkin M., Kulikov A.S., Lesin V.M., Nikolenko S.I., Pham S., Prjibelski A.D. et al. SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol 2012; 19 (5): 455-477.

14. Bolger A.M., Lohse M., Usadel B. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics 2014; 30 (15): 2114-2120.

15. Treangen T.J., Ondov B.D., Koren S., Phillippy A.M. The Harvest suite for rapid core-genome alignment and visualization of thousands of intraspecific microbial genomes. Genome Biol 2014; 15 (11): 524.

16. Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit. Bioinformatics 2012; 28 (8): 1166-1167.

17. Holmes N.E., Turnidge J.D., Munckhof W.J., Robinson J.O., Korman T.M., O'Sullivan M.V., Anderson T.L., Roberts S.A., Warren S.J., Coombs G.W. et al. Genetic and molecular predictors of high vancomycin MIC in Staphylococcus aureus bacteremia isolates. J Clin Microbiol 2014; 52 (9): 3384-3393.

18. Matsuo M., Hishinuma T., Katayama Y., Hiramatsu K. A mutation of RNA polymerase beta' subunit (RpoC) converts heterogeneously vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus (hVISA) into «slow VISA». Antimicrob Agents Chemother 2015; 59 (7): 4215-4225.

19. Katayama Y., Sekine M., Hishinuma T., Aiba Y., Hiramatsu K. Complete Reconstitution of the Vancomycin-Intermediate Staphylococcus aureus Phenotype of Strain Mu50 in Vancomycin-Susceptible S.aureus. Antimicrob Agents Chemother 2016; 60 (6): 3730-3742.

20. Aiba Y., Katayama Y., Hishinuma T., Murakami-Kuroda H., Cui L., Hiramatsu K. Mutation of RNA polymerase beta-subunit gene promotes heterogeneous-to-homogeneous conversion of beta-lactam resistance in methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Antimicrob Agents Chemother 2013; 57 (10): 4861-4871.

21. Matsuo M., Cui L., Kim J., Hiramatsu K. Comprehensive identification of mutations responsible for heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus (hVISA)-to-VISA conversion in laboratory-generated VISA strains derived from hVISA clinical strain Mu3. Antimicrob Agents Chemother 2013; 57 (12): 5843-5853.

22. Gostev V., Kruglov A., Kalinogorskaya O., Dmitrenko O., Khokhlova O., Yamamoto T., Lobzin Y., Ryabchenko I., Sidorenko S. Molecular epidemiology and antibiotic resistance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus circulating in the Russian Federation. Infect Genet Evol 2017; 53: 189-194.


Для цитирования:


Гостев В.В., Калиногорская О.С., Юдин С.М., Дмитренко О.А., Кудрявцева А.В., Сидоренко С.В. Полиморфизм генов, участвующих в сборке клеточной стенки у метициллинорезистентных Staphylococcus aureus со сниженной чувствительностью к ванкомицину. Антибиотики и Химиотерапия. 2018;63(7-8):11-16.

For citation:


Gostev V.V., Kalinogorskaya O.S., Dmitrenko O.A., Yudin S.M., Kudryavtseva A.V., Sydorenko S.V. Cell Wall Biosynthesis Genes Variability in Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus with Reduced Vancomycin Susceptibility. Antibiotics and Chemotherapy. 2018;63(7-8):11-16. (In Russ.)

Просмотров: 40


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0235-2990 (Print)